宏转录组新版结题报告.docVIP

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2020-06-08 发布于江苏
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宏转录组新版结题报告.doc

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诺禾致源宏转录组报告北京诺禾致源生物信息科技有限公司目录 1 概述....................................................................................................................1 2 项目流程............................................................................................................2 2.1 实验上机流程.............................................................................................................. 2 2.1.1 Total RNA 样品检测...........................................................................................3 2.1.2 文库构建及库检................................................................................................. 3 2.1.3 上机测序............................................................................................................. 4 2.2 信息分析流程............................................................................................................... 4 3 分析及结果..................................................................................................... 6 3.1 数据预处理................................................................................................................ 6 3.2 De novo 组装..............................................................................................................7 3.3 物种注释...................................................................................................................... 8 3.4 功能注释.................................................................................................................... 9 3.4.1 eggNOG/COG 注释.......................................................................................... 10 3.4.2 KEGG 注释....................................................................................................... 11 3.4.3 CAZy 注释........................................................................................................ 12 3.5 基因表达水平分析..................................................................................................... 13 3.5.1 参考序列比对...................................