蛋白晶体结构作业.docxVIP

生物大分子结构与功能 什么叫晶体衍射的结构因子？结构因子F与晶体衍射的衍射点的强度I有什么关系？ 结构因子是定量表征原子排布以及原子种类对衍射强度影响规律的参数，即晶体结构对衍射强度的影响因子。 晶体X光衍射强度与几何结构因子的平方成正比 什么叫傅里叶变换？用公式说明为什么说蛋白质晶体的电子密度与晶体衍射的结构因子互为傅里叶变换与反变换的关系？ The?Fourier transform?is a mathematical operation that decomposes a? \o Function (mathematics) function?into its constituent? \o Frequencies frequencies, known as a? \o Frequency spectrum frequency spectrum.?The term Fourier transform refers to both the transform operation and to the complex-valued function it produces. 结构因数同电子密度分布函数之间存在着傅里叶变换的关系：  由傅里叶变换公式得： ?? for every? \o Real number real number?ξ. When the independent variable?x?represents?time?(with? \o SI SI?unit of? \o Second seconds), the transform variable?ξ?represents? \o Frequency frequency?(in? \o Hertz hertz). Under suitable conditions,???can be reconstructed from??by the?inverse transform: ?? for every real number?x. 晶体对X射线的衍射是一种傅里叶变换，把正空间的电子密度变换为倒易空间的衍射强度。 什么叫两个函数的卷积（convolution）？两个函数的卷积的傅里叶变换与这两个函数的傅里叶变换有什么关系？ In? \o Mathematics mathematics?and in particular? \o Functional analysis functional analysis,?convolution?is a? \o Operation (mathematics) mathematical operation?on two \o Function (mathematics) functions?f?and?g, producing a third function that is typically viewed as a modified version of one of the original function. 两函数的傅里叶变换的乘积等于它们卷积后的傅里叶变换。 It also works the other way around: 为什么说晶体的电子密度是晶体里一个晶胞的电子密度与该晶体的晶格的卷积？ 用两个函数的卷积的傅里叶变换的性质推导晶体的X射线衍射的结构因子与晶体里一个晶胞的X射线衍射的结构因子的关系。 Ihkl=|Fhkl|2.Ie 若亚晶块的体积为VC，晶胞体积为V0，则： N=VC/V0 这N个晶胞的HKI晶体衍射的叠加强度为： 考虑到实际晶体结构与之的差别，乘以一个因子， ，则可得： 为什么通常用同晶置换法解蛋白质晶体结构时需要至少两个重原子衍生物？ 同晶置换法需要制备同晶型的重原子衍生物﹐即在不会改变分子和晶体结构的情况下﹐在晶体中引入一种较重的金属原子。这些金属原子在晶体中以和其它原子相同的周期重复规律排列。它们对于 X射线的散射仅影响晶体的衍射强度﹐而不改变衍射方向。这时重原子的结构振幅可由衍生物与天然晶体衍射强度的差值求得。由于晶体中引入重原子的数目有限,我们可以采用别的办法(例如帕特逊函数法)来确定它们的位置,进而可以计算重原子的结构因子。如果能有两个以上同晶型的衍生物﹐就可利用矢量三角形法则求得天然晶体的相位﹐因而也就可以解出这种晶体的结构。这种方法称为多对同晶置换法。当晶体中重原子的吸收边接近入射 X射线的波长时﹐重原子内层的约束电子对于入射线会有很强的散射作用﹐称为反常散射。此时晶体衍射强度的中心对称定律不再成立,即| |≠| |。这就相当于使用一种晶体收集两套衍射强度数据。其效果等于有了两个同晶型的衍生物。因此可以采用类似同晶置换的办法解出晶体结构。这