核苷酸序列剖析.pptVIP

Start codon dons Donor site CGCCATGCCCTTCTCCAACAGGTGAGTGAG Transcription start Exon 5UTR CCTCCCAGCCCTGCCCAC Intron Stop codon GGCAGAAACAATAAAACCAC ATCCCCATGCCTGAGGGCCCCTC 3 UTR  ◆重复序列分析 ◆开放读码框( open reading frame,ORF)的识别 ◆基因结构分析 ◆内含子/外显子剪切位点识别 ◆选择性剪切分析 ◆CpG岛的识别 ◆核心启动子/转录因子结合位点转录启始位 点的识别 ◆转录终止信号的预测 ◆GC含量瘩密码子偏好性分析  ORF 重复序列分析 原核基因组中除rRNA、tRNA基因有多个 拷贝外,重复序列( repetitive sequences) 不多。 哺乳动物基因组中则存在大量重复序列, 分为3类 1.高度重复序列。一般较短,长10~300bp,重复 10次左右,占基因组10%~60%,在人类基因 组中约占20%,功能还不明确  ORF 重复序列分析 2.中度重复序列。长10~300bp,重复10~105次 占基因组10~40%。哺乳类中含量最多的一种 称为Au的序列,长约300bp,重复3×105次,