现代科技综述知识文库：逆转录病毒长末端重复序列的结构和功能.pdf

现代科技综述系列—— 逆逆转转录录病病毒毒长长末末端端重重 复复序序列列的的结结构构和和功功能能 科技是人类区别于动物的重要文明之一， 是人类对自然规律研究 利用的学科。 本文提供对科技基本概念 “逆转录病毒长末端重复序列的结构 功能” 的解读，以供大家了解。 逆逆转转录录病病毒毒长长末末端端重重 复复序序列列的的结结构构和和功功能能 自1970年 Temin Baltimore首次发现逆转录酶后，逆转 录病毒的名字才被广泛采用，而且关于此类病毒复制 的假说也被普遍接受，即由逆转录酶将病毒的RNA逆 转录成DNA后整合到宿主细胞染色体上，整合的病毒 DNA在宿主细胞RNA聚合酶Ⅱ的作用下转录成RNA， 此RNA可作为子代病毒核酸被包装在病毒粒子内，或 进一步剪接成mRNA再翻译成病毒蛋白。 逆转录病毒分布广泛，几乎各种动物都有感染。 与大多数其它类型的动物病毒不同的是逆转录病毒感 染很少导致细胞的破坏，一旦感染即可终身带毒，有 些还可直接或间接导致肿瘤。 逆转录病毒的这些特征与其前病毒DNA上的长末端重 复序列(LTR)有密切的关系。 逆转录病毒的RNA 其复制中间体DNA的末端都含重 复序列，但互不相同。 在DNA末端含有一段非常小的重复序列(8～247个核苷 酸)，称为r系列，而病毒DNA的两末端都有一长末端 重复序列。 不同的逆转录病毒LTR都是U3 、R U 3个区域组成， 但大小不一。 RNA末端的重复序列对于病毒DNA的合成起重要作 用，而病毒DNA的LTR对于病毒DNA的整合必不可 少，并控制病毒RNA的转录，具有转录启动子等作 用。 逆转录病毒RNA分子的 ′末端有一帽子结核，其后是 一段长为8～247个核苷酸的系列(r)，此系列在病毒 RNA的3′末端重复出现，紧接着 ′端r系列的是另一长 为 ～203个核苷酸的U 系列，在3′端与r系列相邻的 是U3 区域，大小为187～1194个核苷酸。 在以病毒RNA为模板进行逆转录时，先从 ′末端拷贝 U R系列，此系列(DNA形式)被转移到3′末端，R系 列与r系列结合作为引物再拷贝3′端的U3 区，这样逆转 录形成的U3 －R －U 系列(即为LTR)作为模板合成另一 拷贝的LTR ，然后转移到病毒DNA的 ′末端。 在病毒RNA ′末端U 系列之后是两个UMP残基(对鼠乳 腺瘤病毒是GMP CMP残基)，接着就是18～2 1个碱基 的系列，这一区域与对不同逆转录病毒具有特异性的 一种细胞tRNA3′端的核苷酸链是互补的。 这种细胞tRNA是病毒负链DNA合成时的引物，目前已 知的引物tRNA有赖氨酸(Lys)，脯氨酸(Pro) 色氨酸 (Trp) 。 整合的前病毒两末端都有LTR ，而且排列方向相同， 在每个LTR 中，两极端的核苷酸是相互反向重复的， 所以整个病毒DNA实际上也具有末端反向重复序列。 对于同一逆转录病毒来说，不同毒株的LTR 的核苷酸 系列 大小是相似的，但不同病毒之间有很大差异。 系列分析结果证明各逆转录病毒的LTR之间也有一定 的同源系列存在，这些同源系列可能对前病毒的整合 以及病毒的RNA合成的控制起重要作用。 LTR末端的反向重复序列大小在3～16碱基对之间，所 在整合的前病毒LTR 的末端都是，除MMTV外，所有 未整合的病毒DNA末端反向重复序列都比整合的前病 毒多2个碱基对。 在LTR 的R 区前7 碱基对的U3 区通常有一CCAAT系 列，在R 区前23碱基对的地方，总是有一系列(即 TAT