密码子偏好性分析.ppt

密码子偏好性分析 陈永红 孟如月 制 ? 密码子是核酸携带信息和蛋白质携带信息间 对应的基本原则 , 是生物体内信息传递的基本 环节。在 ? 生物的遗传密码中 , 除色氨酸和甲硫氨酸只有 一个密码子外 , 其余氨基酸都有一个以上的简 并密码子。对 ? 同一物种 , 不同蛋白编码密码子在基因中出现 的频率不同 ; 就同一种氨基酸而言 , 编码该氨 基酸的不同密 ? 码子的比率在不同的蛋白中也有差异 , 因此生 物体基因对简并密码子的选择具有一定的偏 爱性。 ? 同义密码子 (Synonymous Codons) ：编码同一氨基酸 的密码子。 ? 在蛋白质编码过程中 , 某一物种或某一基因通常倾向 于使用一种或几种特定的同义密码子 , 这种现象称为 同义密码子的使用偏性 (Synony mous Codon Usage Bias) ? 研究密码子使用偏性的意义： ? （一）作为预测真核生物核糖体在细胞内定位的一种 手段 ，通过比较核基因编码的核糖体蛋白和线粒体基 因编码的核糖体蛋白上密码子使用模式的差异来预测 未知蛋白的基因所在基因组位置。 ? （ 二）通过密码子使用偏好性的研究， 可以判定一些最优 密码子，针对这些密码子设计基因