分子动力学学的方法.ppt

分子动力学方法 ●●●●● ●●●● ●●●●● ●●●  @@ 3.1基本原理 计算机模拟分类 (1)随机模拟方法。 优点:随机模拟方法计算的程序简单,占内存少,但 是该方法难于处理非平衡态的问题 (2)分子动力学方法( Molecular dynamics或简称 MD 可以处理非平衡态问题。但是使用该方法的程序较 杂,计算量大,占内存也多 分子动力学方法利用牛顿古典力学来计算许多分子  @@ 3.1基本原理 分子动力学(MD)方法的出发点是物理系统的确定的微 观描述(哈密顿描述方程、拉格朗日方程或牛顿运动 方程)。因此,分子动力学方法是用运动方程来计算 多体或少体系统的性质,结果得到的既有系统的静 特性,也有动态特性。蒙特卡罗方法只能得到系统的 位形特性 ·M方法的具体做法是在计算机上求运动力程的数值解 为此,通过适当的格式对方程进行近似,使之适于在 计算机上求数值解。甚实质是计算一组分子的相空间 轨道,其中每个分子各自都服从经典运动定律。这里 的系统不仅是点粒子系统,也包括具有内部结构的粒 子组成的系统  @ 3.1基本原理 1.分子动力学是在原子、分子水平上求解多体问题 的重要的计算机模拟方法 2.通过求解所有粒子的运动方程,分子动力学方法 可以用于模拟与粒子运动路径相关的基本过程 3.在分子动力学中,粒子的运动行为是通过经典的 Newton运动方程所描述。  @ 3.1.1粒子运动方程的数值求解 粒子体系的运动方程 agranglan方程 1. Lagrangian函数的定义为 C=K-1 k 则运动的 Lagrangian方程为 d ar or dt