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耐药细菌基因组测序结果分析流程
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cFCC57BHAC:1:1215:21257:98676#/2
1.拼接 Assembly
Spades
Statistics without reference scaffolds
contigs (= 1000 bp)
g
Total length(= 1000 bp)
5280561
N75
150
GC(%)
55.09
1.拼接 Assembly
NODE 1 length 316920 cov 11. 6967 ID 1
组装后的
CCCGGCMAGTGTTTATT
TACGGCGICTCCAGCTC
Scaffold
CCAATCTGCTCCGGCGTCAACGATAAGTCCACCGCACTTAACAACTCATOCACCTGTTC
TAACGCATCOCTCGCTTCTGTATCGTCATACACGTTTTTAOCCACTTCATOCCATACCAI
CCGGGCGGTAGTTTCOOCCCACGGACGGGTTAACCTTCCGCGCGCCAGCGGGCTCCACGG
.TCAGGTTGTAGTGATOCTGCATAGTGACAAAGCGCGOCCAGCCGTGCTGCCCCTGGAG
ATCGAGCOOCTGGCAACTGTGAGGCATGCATGGACGATGOGCCGATGTAGCGCGCTTT
GCGGTGGATTTGCAGCAGGTCGACGTAATCCATGTTCAGCCGTCTGAGOCTGTCATC
AATGGAACOCAGGATCTGCOCGCGAGAAAGGCCTTCCGCCAGATCGCCTGACGCGTAGTA
AATCTCTTCCCTGCTGCCG
CGTTTTToCTAATGTCGTGLATTGCATGGTTCOGCTCCTGCTGTTTAAACAATACGTTTA
GCATACCAGGAGCAGAAAAGGGGA
ATACCGGCGOCGTCCAGACTAATGTCGGCCCGCGCCTCATOCTGGGTGOCTTGCGGGATG
GTGGTCAGGGAGGCCGAGATTAAGCACCGGAACGGCTTTACGCTTCGCCATCAGCACT
2.注释 Annotation we
● Prokka
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产生gbk和sq等文件
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