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间接药物设计II
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间接药物设计II
三、基于定量构效关系的药物设计
定量构效关系QSAR —— 揭示一组化合物的生物活性与其分子结构特征之
间的相互关系,以数学模型表达和概括出量变规律,以此设计新的化合物
活性 = f (分子或片断性质)
间接药物设计II
QSAR:
Quantitative Structure Activity Relationships (2D and more recently 3D).
Attempts are made to identify (non)linear relationships that exist between physical
and/or chemical properties (logP, hydrophobicity/hydrophilicity, frontier molecular
orbitals (HOMO, LUMO), solubility/free energy of hydration, pKa(s), etc.) and
activity (inhibition).
间接药物设计II
QSAR
2D-QSAR
3D-QSAR
线性自由能相关方法 、
Free-Wilson模型 COMFA COMSIA
Hansch分析法
2
log1/C = -k π + k π+ k σ+ k E + k log 1/C = a X +
1 2 3 4 s s ij ij 比较分子力场分析法 比较分子相似性指数分析法
C :产生指定生物效应的克分子浓度
同源系列中的每一化合物的生物活
π:疏水性参数
性log 1/C是母体结构对生物活性
σ:电子效应参数
贡献与取代基对活性贡献a 之和
Es:立体参数 ij
k k k 和 k :权重系数
1、 2、 3 4
立体场、静电场
氢键场、疏水场
间接药物设计II
药物设计中的数据统计方法
数据统计——广泛使用计算机的计算和人工智能
• 人工智能 —— 计算机科学中研究使计算机能够模仿智能的某些方面,如识别
、推理、演绎、从经验中学习的能力以及从不完全的信息中进行推理的能力。
模式识别 PR
专家系统 ES
人工智能 智能数据库 DB
人工神经网络 ANN
…………
间接药物设计II
数据统计中广泛使用的计算和
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