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第二章 酶学基本原理 ;酶--;第一节 酶的分类、组成;(3)EC 命名法;2、酶的分类;氧化-还原酶催化氧化-还原反应。
主要包括脱氢酶(dehydrogenase)和氧化酶(Oxidase)。
如乳酸(Lactate)脱氢酶催化乳酸的脱氢反应。;转移酶催化基团转移反应,即将一个底物分子的基团或原子转移到另一个底物的分子上。例如: 谷丙转氨酶催化的氨基转移反应; 酶的分类3:水解酶 hydrolase;裂合酶催化从底物分子中移去一个基团或原子形成双键的反应及其逆反应。
主要包括醛缩酶、水化酶及脱氨酶等。
例如:延胡索酸水合酶催化的反应
;异构酶催化各种同分异构体的相互转化,即底物分子内基团或原子的重排过程。例如:6-磷酸葡萄糖异构酶催化的反应;合成酶,又称为连接酶,能够催化C-C、C-O、C-N 以及C-S 键的形成反应。这类反应必须与ATP分解反应相互偶联。
A + B + ATP + H-O-H ===A-B + ADP +Pi
例如:丙酮酸羧化酶催化的反应。
丙酮酸 + CO2 ? 草酰乙酸;核酸酶是唯一的非蛋白酶。它是一类特殊的RNA,能够催化RNA分子中的磷酸酯键的水解及逆反应。
( to RNA flase );抗体通过对抗原的包裹、降解等作用使抗原失活,其生物特性十分类似于酶。
(to antibody flash);二、酶的组成:酶蛋白、辅酶(coenzyme)辅基和金属离子;辅因子:酶蛋白中非蛋白质部分,它可以是无机离子也可以是有机化合物。
;全酶的结构;辅酶在酶促反应中的作用;酶分子中的金属离子;金属酶中离子催化作用 ;? 电荷屏蔽作用;? 电子传递中间体 ;金属激酶中的金属离子;第二节 酶的结构与功能 ;一、酶蛋白的结构;1、酶蛋白的一级结构;胰岛素的一级结构及不同动物胰岛素在A链中的差异 ;2、酶的二级结构;α-螺旋(α-helix) ;β-折叠(β-sheet) ;;β-转角(β-turn) ;蛋白质的二级结构;3、酶的三级结构;;4、四级结构(quaternary structure);丙酮酸脱氢酶系(E.coli):丙酮酸脱氢酶(EⅠ)、硫辛酰转乙酰酶(EⅡ)和二氢硫辛酰脱氢酶(EⅢ)。;四级结构:在亚基和亚基之间通过疏水作用等次级键结合成为有序排列的特定的空间结构。
四级结构的蛋白质中每个球状蛋白质称为亚基,亚基通常由一条多肽链组成,有时含两条以??的多肽链,单独存在时一般没有生物活性 ;二、活性中心与必需基团;;41;酶分子中促使底物发生化学变化的部位称为催化部位。
通常将酶的结合部位和催化部位总称为酶的活性部位或活性中心。
结合部位决定酶的专一性,
催化部位决定酶所催化反应的性质。;酶分子中存在着一些可以与其他分子发生某种程度的结合的部位,从而引起酶分子空间构象的变化,对酶起激活或抑制作用。;主要包括:
亲核性基团:丝氨酸的羟基,半胱氨酸的巯基和组氨酸的咪唑基。;酸碱性基团:门冬氨酸和谷氨酸的羧基,赖氨酸的氨基,酪氨酸的酚羟基,组氨酸的咪唑基和半胱氨酸的巯基等。;三、 酶催化作用机制
1、酶催化作用特点
(1)高度专一性;(2)催化效率高
催化转换数:每个酶分子每分钟催化底物转化的分子数。
酶催化的转换数一般为103min-1左右。比非催化高108~1020;比非酶催化的反应速度高107~1013倍。
碳酸酐酶最高为3.6* 107min-1
(3)催化条件温和
一般在常温、常压及pH接近中性条件下进行;2、酶作用专一性的机制;A、“三点结合”的催化理论;B、锁钥学说 Lock Key theory;C、诱导楔合学说 ;(3)酶作用高效率的机制 ;53;;;酶促反应:E + S === ES ??EP?? E + P
反应方向, 即化学平衡方向,主要取决于反应自由能变化?H?。
而反应速度快慢则主要取决于反应的活化能Ea。
催化剂的作用是降低反应活化能Ea,从而起到提高反应速度的作用?;反应过程中能的变化;酶催化作用的本质是酶的活性中心与底物分子通过短程非共价力(如氢键,离子键和疏水键等)的作用,形成E-S反应中间物。
其结果使底物的价键状态发生形变或极化,起到激活底物分子和降低过渡态活化能作用。 ;第三节 酶动力学 ;一、米氏方程;米氏常数Km的意义;米氏常数的求法:双倒数作图法;二、抑制作用;酶的可逆抑制作用;例: 丙二酸对琥珀酸脱氢酶的抑制作用;竞争性抑制作用;非竞争性抑制(noncompetitive inhibition) :
是指抑制剂与底物分别与酶分子上的不同位点结合,引起酶活性降低的抑制作用。
;非竞争性抑制作用;反竞争性抑制(uncompetitive inhib
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