蛋白质组中心-质谱数据分析4讲解学习.ppt

质谱测试分析 博苑蛋白质组技术服务中心 蛋白质质谱鉴定流程 样品 酶解 酶解片断 一级质谱 PMF 肽指纹图谱 串联质谱 对库 检索 序列数据库 成功鉴定 PSMs及后筛选 De-novo 序列分析 未知蛋白 肽指纹图谱（PMF）鉴定 PMF（Peptide Mass Fingerprinting）是根据一级质谱（MS）所测酶解片段的精确分子质量鉴定蛋白质的一种方法。 一般采用MALDI-TOF仪器进行。因为MALDI质谱图中的离子一般只带一个电荷，比较容易计算。 其原理就是利用了蛋白序列数据库中的多肽质量的信息与实际测得的质量信息进行对比而实现鉴定。 二级质谱鉴定 质谱仪选择一级质谱中的一个峰，让这些峰所代表的离子高速撞击质谱仪中的惰性气体，使其肽键断裂，并对库搜索鉴定蛋白质。 常用MALDI-TOF／TOF仪器进行。 优点与缺点 优点： 鉴定准确度更高，可以得到蛋白的序列 可以实现多个蛋白的鉴定 缺点： 增加了一步操作 算法更复杂，而且需要更多的操作经验 串联质谱结果报告 从一级质谱图里选出部分峰做二级质谱 一级质谱图 二级质谱图 蛋白点编号 蛋白名称 蛋白GI号 串联质谱匹配的序列 理论等电点 理论分子量 串联质谱离子得分 可信度 串联质谱结果报告