基因组学与后基因组时代研究热点.ppt

第八章 基因组学和后基因组时代研究热点;第一节 基因组和基因组学 第二节 蛋白组学 第三节 代谢组学 第四节 人类元基因组计划;重点掌握：;基因研究是20世纪生命科学的主线; ★ 20世纪下半叶，以分子生物学为代表，生命科学通过对基因复制、转录、翻译及遗传密码的分析与破译，最终以统一生命世界各层次，生命科学各分支的“中心法则”的问世而集成。; ★ 20世纪90年代,随着全球基因组计划，尤其是人类基因组计划(HGP)规模空前、速度惊人的推进，基因研究已接近“登峰造极”，???类对生命世界的理性认识达到了前所未有的深度与广度。;第一节基因组和基因组学（Genome and Genomics ）;1.1 基因组（Genome）:;★1986年, 美国科学家 Thomas Roderick 首先提出了基因组学 (genomics) 的概念。指对所有基因进行基因组作图（包括遗传图谱，物理图谱和转录图谱），核苷酸序列分析，基因定位和基因功能分析。; ★ 基因组学应该包括两方面内容：以全基因组测序为目标的结构基因组学 (structural genomics) 和以基因功能鉴定为目标的功能基因组学 (functional genomics) ，后者又称后基因组研究 (post-genome).;1986年３月７日，美国科学家、诺贝尔奖获得者、肿瘤病毒专家雷托·杜伯克在美国《科学》杂志上发表了一篇题为《癌症研究的转折点—人类基因组的全序列分析》的短文，提出有关分析人类基因组全序列的重要科学构想。; 杜伯克在这篇文章后来被称为“人类基因组计划课题标书” ，成为日后国际人类基因组计划启动和实施的重要推动力。 经过反复讨论，数易其稿，1990年美国国会正式批准了人类基因组计划。? ;;1.2人类基因组计划(human genome project, HGP );★ HGP的本质是对人类基因组进行作图和序列测定，旨在破译人类所有的遗传信息。;In 1998, Craig Venter 挑战国际人类基因组计划 ;GREAT EXPECTATIONS 26th JUNE 2000;★ 2001年2月12日,美,日,德,法,英,中六国科学家和美国赛莱拉公司联合公布了人类基因组图谱（草图）及初步分析结果. ;文特尔小组所做的人类基因组测序报告发表在《科学》杂志上（99%)，科林斯带领的公共资金支持的实验室联合体的报告同时发表在《自然》杂志上（85%)—两个研究组织同时公开他们的研究成果，但不是联合研究的成果。私人公司公开与公共研究机构叫板，最后与对手一起站在领奖台上。 ;"Shotgun sequencing" determinate the genome sequence of Haemophilus influenzae (H. influenzae) “鸟枪法”测定流感嗜血杆菌（H. influenzae）基因组;Mechanism of DNA shotgun sequencing;Sequencing Strategy of Human genome;★人类基因组精细序列图于2003年4月23日宣告完成，完成，但其中大量基因的结构和功能尚不清楚。 ;★与人类同步进行基因组测序的模式生物有：大肠埃希菌、酵母、线虫、果蝇、小鼠、拟南芥及一些与人类关系密切的哺乳动物。 Yeast is the first single-cellular eukaryote sequenced (1996), 酵母是第一个完成测序的单细胞真核生物(1996)， Elegans is the first multicellular organisms sequenced (1998),线虫是第一个完成测序的多细胞生物(1998) 。;狗 2003.9 玉米 2003 10 蜜蜂 2004.1 小鼠（Mus musculus ） 2004. 10 腔棘鱼 2004. 11 稻瘟病菌 (Magnaporthe Grisea ) 2005.4 海藻栽培品种——坛紫菜 2005.4 变形虫“阿米巴”（Dictyostelium discoideum）2005.5 Sino-Danish Pig Genome Project 2005.6 黑猩猩 2005.9 牛的全基因组 2006.8 石油去污菌的基因组 2006.8 聚羟基脂肪酸酯类(Polyhydroxyalkanoates,??PHAs)产生菌富养罗尔斯通氏菌(Ralstonia??eutropha??H16)基因组 2006.9 15种小鼠品系 2006.10 黑曲霉基因组测序 2007.2 Syntrophus aciditrophicus一种极端厌氧菌基因组 200