马铃薯种质资源疮痂病抗性评价及转录组分析.pdfVIP

马铃薯种质资源疮痂病抗性评价及转录组分析.pdf

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目 录 摘 要 I Abstract III 1 文献综述 1 1.1 马铃薯生产现状概述 1 1.2 马铃薯疮痂病的发生与危害 2 1.3 马铃薯疮痂病的防治 4 1.3.1 农业防治 4 1.3.2 化学防治 4 1.3.3 生物防治 5 1.3.4 选育抗病品种 6 1.4 植物抗性与表型性状的研究 6 1.4.1 植物表型性状对抗病性的影响 6 1.5 转录组学研究进展 7 1.5.1 转录组学研究进展 7 1.5.2 马铃薯转录组学研究进展 8 1.6 本研究的目的与意义 9 2 材料与方法 11 2.1 试验材料 11 2.1.1 供试马铃薯种质资源 11 2.1.2 供试菌株 12 2.1.3 供试培养基 12 2.2 试验方法 12 2.2.1 供试菌株的繁殖与接种体的制备 12 2.2.2 盆栽接种鉴定 12 2.2.3 马铃薯块茎表型性状调查 14 2.2.4 转录组测序 15 3 结果与分析 21 3.1 马铃薯疮痂病抗病性鉴定 21 I 3.2 马铃薯抗疮痂病的块茎表型性状 23 3.2.1 马铃薯疮痂病抗性与表皮皮孔密度的关系 26 3.2.2 马铃薯疮痂病抗性与块茎部分表型性状的相关性 28 3.3 疮痂病菌侵染马铃薯块茎的转录组分析 29 3.3.1 RNA-seq 数据整体分析 29 3.3.2 RNA-seq 样品基因表达量总体分布 32 3.3.3 差异表达基因(DEGs )分析 33 3.3.4 差异表达基因的 GO 分析 34 3.3.5 差异表达基因(DEGs )的KEGG 分析 36 3.3.6 差异表达基因的转录因子(TF )分析 44 3.3.7 响应疮痂病菌胁迫的候选基因筛选 47 3.3.8 相关差异表达基因 qRT-PCR 验证 47 4 讨论 51 4.1 种质资源的疮痂病抗性鉴定 51 4.2 马铃薯块茎表型性状与疮痂病抗性的关系 52 4.3 疮痂病菌胁迫下马铃薯块茎转录组学分析 52 4.4 马铃薯响应疮痂病胁迫候选基因挖掘 53 4.5 研究展望 54 5 结论 55 5.1 马铃薯种质资源盆栽抗性鉴定 55 5.2 马铃薯块茎表型性状与疮痂病抗性的关系 55 5.3 马铃薯疮痂病菌胁迫下差异表达基因分析 55 参 考 文 献 57 致 谢 69 个人简历 71 II Contents Abstract in Chinese I Abstract in English III 1 Literature Review 1 1.1 Overview of Potato Production 1 1.2 Occurrence and Damage of Potato Common Scab 2 1.3 Prevention and treatment of Common scab 4 1.3.1 Agricultural Control 4 1.3.2 Ch

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