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目 录
摘 要 I
Abstract III
1 文献综述 1
1.1 马铃薯生产现状概述 1
1.2 马铃薯疮痂病的发生与危害 2
1.3 马铃薯疮痂病的防治 4
1.3.1 农业防治 4
1.3.2 化学防治 4
1.3.3 生物防治 5
1.3.4 选育抗病品种 6
1.4 植物抗性与表型性状的研究 6
1.4.1 植物表型性状对抗病性的影响 6
1.5 转录组学研究进展 7
1.5.1 转录组学研究进展 7
1.5.2 马铃薯转录组学研究进展 8
1.6 本研究的目的与意义 9
2 材料与方法 11
2.1 试验材料 11
2.1.1 供试马铃薯种质资源 11
2.1.2 供试菌株 12
2.1.3 供试培养基 12
2.2 试验方法 12
2.2.1 供试菌株的繁殖与接种体的制备 12
2.2.2 盆栽接种鉴定 12
2.2.3 马铃薯块茎表型性状调查 14
2.2.4 转录组测序 15
3 结果与分析 21
3.1 马铃薯疮痂病抗病性鉴定 21
I
3.2 马铃薯抗疮痂病的块茎表型性状 23
3.2.1 马铃薯疮痂病抗性与表皮皮孔密度的关系 26
3.2.2 马铃薯疮痂病抗性与块茎部分表型性状的相关性 28
3.3 疮痂病菌侵染马铃薯块茎的转录组分析 29
3.3.1 RNA-seq 数据整体分析 29
3.3.2 RNA-seq 样品基因表达量总体分布 32
3.3.3 差异表达基因(DEGs )分析 33
3.3.4 差异表达基因的 GO 分析 34
3.3.5 差异表达基因(DEGs )的KEGG 分析 36
3.3.6 差异表达基因的转录因子(TF )分析 44
3.3.7 响应疮痂病菌胁迫的候选基因筛选 47
3.3.8 相关差异表达基因 qRT-PCR 验证 47
4 讨论 51
4.1 种质资源的疮痂病抗性鉴定 51
4.2 马铃薯块茎表型性状与疮痂病抗性的关系 52
4.3 疮痂病菌胁迫下马铃薯块茎转录组学分析 52
4.4 马铃薯响应疮痂病胁迫候选基因挖掘 53
4.5 研究展望 54
5 结论 55
5.1 马铃薯种质资源盆栽抗性鉴定 55
5.2 马铃薯块茎表型性状与疮痂病抗性的关系 55
5.3 马铃薯疮痂病菌胁迫下差异表达基因分析 55
参 考 文 献 57
致 谢 69
个人简历 71
II
Contents
Abstract in Chinese I
Abstract in English III
1 Literature Review 1
1.1 Overview of Potato Production 1
1.2 Occurrence and Damage of Potato Common Scab 2
1.3 Prevention and treatment of Common scab 4
1.3.1 Agricultural Control 4
1.3.2 Ch
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