海南橡胶树棒孢霉落叶病菌毒素基因鉴定及基因组学分析.pdfVIP

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2020-08-18 发布于江西
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海南橡胶树棒孢霉落叶病菌毒素基因鉴定及基因组学分析.pdf

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目录目录摘要I Abstract Ⅲ 1 文献综述 1 1.1 橡胶树棒孢霉落叶病研究概况 1 1.1.1 橡胶树棒孢霉落叶病的发生与危害 1 1.1.2 橡胶树棒孢霉落叶病菌生物学特性2 1.1.3 橡胶树棒孢霉落叶病的发病规律 3 1.1.4 橡胶树棒孢霉落叶病菌的致病机理研究 3 1.1.5 防治技术4 1.2 多主棒孢霉的分子生物学研究概况 5 1.2.1 分子检测 5 1.2.2 分子遗传多样性 5 1.2.3 Cassiicolin 毒素分子特征 6 1.2.4 橡胶树棒孢霉落叶病菌基因组学研究进展 6 1.3 研究目的与意义 7 2 材料与方法 9 2.1 材料 9 2.1.1 供试材料 9 2.1.2 主要试剂及培养基 9 2.1.3 主要仪器设备 9 2.2 试验方法 10 2.2.1 橡胶树棒孢霉落叶病菌分离与纯化 10 2.2.2 病原菌菌落和分生孢子形态观察 11 2.2.3 病原菌分子鉴定 11 2.2.4 毒素蛋白亚型鉴定 13 2.2.5 橡胶树棒孢霉落叶病菌致病性分化检测 15 2.2.6 Cas5 毒素蛋白基因结构分析 15 2.2.7 Cas5 毒素蛋白基因表达水平分析 16 I 海南橡胶树棒孢霉落叶病菌毒素基因鉴定及基因组学分析 2.2.8 DZ-27 菌株基因组测序与分析 17 3 结果与分析21 3.1 橡胶树棒孢霉落叶病菌鉴定21 3.1.1 橡胶树棒孢霉落叶病菌的分离与纯化21 3.1.2 菌株形态鉴定22 3.2 橡胶树棒孢菌落叶病菌分子鉴定25 3.3 橡胶树棒孢霉落叶病菌致病性分化检测28 3.4 橡胶树棒孢霉落叶病菌毒素蛋白亚型的检测 30 3.5 Cas5 毒素蛋白基因结构 30 3.6 橡胶树棒孢霉落叶病菌Cas5 毒素蛋白基因表达水平分析 31 3.7 橡胶树棒孢霉落叶病菌DZ-27 的全基因组测序 33 3.7.1 DZ-27 菌丝DNA 质量检测 33 3.7.2 DZ-27 基因组组装统计和重复序列预测结果 33 3.7.3 DZ-27 基因组测序数据过滤 34 3.7.4 DZ-27 蛋白编码基因的GO 注释 36 3.7.5 DZ-27 蛋白编码基因的COG 功能注释 37 3.7.6 DZ-27 蛋白编码基因的KEGG 注释 38 3.7.7 DZ-27 蛋白编码基因的egg NOG 注释 39 4 讨论41 4.1 橡胶树棒孢霉落叶病菌的分离与鉴定41 4.2 橡胶树棒孢霉落叶病菌的致病性42 4.3 橡胶树棒孢霉落叶病菌毒素蛋白类型42 4.4 橡胶树棒孢霉落叶病菌Cas5 毒素蛋白基因表