昆虫分子鉴定技术简介.幻灯片课件.pptVIP

二、昆虫DNA条形码 2、DNA条形码 Herbert等于2003年提出DNA条形码概念（DNA Barcoding） 。利用线粒体cox1基因（线粒体细胞色素氧化酶亚基I基因，5端648 bp）作为通用序列，建立全球性的物种鉴别系统。 从理论上讲，15 个碱基位点就有415种编码方式，这个数目是现存物种的100倍。在蛋白质编码基因中的第3 位密码子碱基是可以自由变换的。因此，只需一段45个碱基长度的序列便可编码近10 亿的物种， 所以理论上 DNA 条形码这段648 bp 的序列完全可以鉴定所有物种。 cox1 相对保守又有足够的变异，并且序列长度适中。 该基因不存在内含子，是蛋白编码基因，所以便于比对，且可通过翻译检测错误，极少出现重组、 插入和缺失。 1460 3014 UEA5/UEA6、UEA7/UEA8和UEA5/UEA8：相对保守——高水平（科、属、种）系统发育研究 UEA3/UEA4 (or UEA4d) 和UEA9/UEA10：较为变异——种群遗传学研究（种内或近缘物种系统发育） 2、DNA条形码 预先收录已知物种的cox1基因-建立数据库-未知种名物种cox1输入检索-据相似度鉴定物种。 DNA条形码的操作流程主要有以下几个步骤：1)标本采集、整理、鉴定、描述；2)基因组DNA提取；3)DNA条形码标准基因的PCR扩增；4)PCR产物纯化及DNA序列测定；5)D