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人类细胞质RNA提取
RT-PCR的原理、方法
琼脂糖凝胶电泳结果分析及其应用
第六组
人类细胞质RNA提取
真核细胞质总RNA主要由rRNA(80
85%)
tRNA和核内小分子RNA(10-15%)、mRNA
(1-5%)
组成,其中rRNA、tRNA和mRNA位于细胞
质中。
分离提纯A的目的
分析不同发育时期基因的表达状况
获得新基因
研究基因的拼接
分析相应的蛋白产物
A的不定性
由于核糖残基的2’和3’位置带有羟基,
RNA
易于被RNA酶切割水解
RNA酶含量丰富,加热后仍能够正确折
叠恢复活
性,不易失活。
所以需要RNA酶抑制剂来抑制RNA酶的
活性
RNA的质量决定了你能够转录到cDNA上
的序列信息量的最大值。
(1)常用的RNA酶抑制剂
焦碳酸二乙酯(DEPC)
是一种强烈但不彻底的RNA酶抑制剂。
它通过和RNA酶的活性基团组氨酸的咪
处人伟白质亦
异硫氰酸胍:目前被认为是最有效的RNA酶抑制
剂,它在裂解组织的同时也使RNA酶失活。它既
可破坏细胞结构使核酸从核蛋白中解离出来,又
对RNA酶有强烈的变性作用。
氧钒核糖核苷复合物:由氧化钒离子和核苷形成
的复合物,它和RNA酶结合形成过渡态类物质,
几乎能完全抑制RNA酶的活性。
RNA酶的蛋白抑制剂( RNas in):从大鼠肝或人
胎盘中提取得来的酸性糖蛋白。 RNas in是RNA酶
的一种非竞争性抑制剂,可以和多种RNA酶结合
,使其失活。
(2)RNA提取的一般步骤
破碎组织→分离RNA→沉淀RNA→洗涤
RNA→融解RNA→保存RNA
①破碎组织和灭活RNA酶可以同步进行
可以用盐酸胍、硫氰酸胍、NP-40、SDS、蛋白
酶K等破碎组织
●加入B-ME可以抑制RNA酶活性
分离RNA
半用酚、氯仿等有机溶剂,加入少量异戊
醇,经过此步,离心,RNA一般分布于上层
与
蛋白层分开
沉淀RNA
般用乙醇、3 M NaAc(pH-5.2)或异丙醇
④洗涤RNA
使用70%乙醇洗涤,有时,为避免RNA被洗掉
此步可以省掉,洗涤之后可以晾干或者烤
千乙醇,但是不能过于干燥,否则不易溶解
⑤融解RNA
般使用TE
⑥保存RNA
应该尽量低温。为了防止痕量 RNase的污染,从
富含 RNase的样品(如胰脏、肝脏)中分离到的
RNA需要贮存在甲醛中以保存高质量的RNA,对于
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