taqman法SNP基因分型引物设计及Primer expressss教程 如需帮助设计引物,请私信 taqman法SNP基因分型引物设计及Primer expressss教程 一、 SNP引物、探针设计原则 二、 primer express软件设计教程-以rs2243106为例 扩增产物控制在50-150 bp,以便获得最大扩增效率。 探针长度设计在13-25 bp,且位置不与上下游引物重叠。 探针Tm值控制在65-67度,GC含量在30-80%。 探针5端避免G,以免淬灭荧光基团. 两条探针的Tm值相差不要超过1℃ SNP位置应在探针的1/3-2/3处(5’-3’),必要时,可以移向3’端,但不可以放在最后两个碱基的位置上。 taqman法SNP基因分型引物设计及Primer expressss教程 SNP位置 SNP位置必要时可以移向3’端 但不可以在最后两个碱基 SNP位置最好在探针1/3-2/3间 taqman法SNP基因分型引物设计及Primer expressss教程 1.SNP序列的获得 (1)在NCBI的SNP数据库()中输入SNP号,可以很方便的获得位点信息,但显示的序列较短,无法用于设计引物。即:ACTATTGCTACACTCAGTTTCCCAA[C/T]TGCTCCTGTATAATCTTGTCTTCTG。如下图所示: (2)因此,可以通过点击SNP
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