pdb数据库中查找蛋白质结构数据.pdfVIP

一、PDB 数据库中查找蛋白质结构数据 1.　/pdb/home/home.do 2. 查找蛋白质结构，在检索框输入关键字或名称。 输入内容：比如 2DC3 二. 在线观看三维数据结构 4. 选择 3D view ，可视化蛋白三维结构视图呈现。由于是远程计算机服务器进行图型构建， 且数据量较大，需要较长的时间才能在窗口显示。 5.蛋白结构显示的参数设定： 自定义设定 脚本选项： 二、下载三维数据文件 1. 在查询结果窗口的右边找到以下图型。 如图：选择 Download Files 。 2 ．确定下载的文件类型，一般根据你要使用蛋白质结构数据而定。 选择 PDB File(Text). 3. 用写字板打开 PDB 文件，可以看到蛋白质数据库文件实质也是文本文件。 4. 下载 Pymol ，并安装。点DOWNLOAD 进入下载，选择 windows 版本，并安装（需要 pay money ）。 或到此网站下载：/~gohlke/pythonlibs/#pymol 选择 win32 ， 版本。并安装，需要 python 编程软件的支持，可从 360 软件管件直接安 装。安装如图： 使用详情参见教程，注意打开程序需要找到 python 的安装目录：C:\Python27\PyMOL ，找 到 PyMOL.exe 文件，双击启动程序。 打开 2DC3.pdb 或使用 RasMol 软件进行三维视图分析，步骤同上。