“分子动力学模拟技术与应用”系列培训班.docVIP

关于举办“分子动力学模拟技术与应用”系列培训班的通知 各有关单位: 分子动力学模拟被广泛用于生命科学、化学工程、物理、医药、材料科学等领域。由于传统实验需要大量的人力物力而且耗时，而计算机模拟的方法省时省力，能有效提高科研效率；目前，分子动力学模拟能在很大程度上进行预测指导实验，因此模拟与实验的对照是将来研究的主要方向之一。分子动力学模拟作为一种理想的计算机模拟方法，可以用来模拟两相之间的相互作用，也是对计算和实验的补充。应新老客户的培训需求，北京软研国际信息技术研究院特举办“LAMMPS分子动力学模拟技术与应用”培训班及“GROMACS分子动力学模拟技术与应用”培训班，本次培训由互动派（北京）教育科技有限公司具体承办，通过本次培训，能够了解LAMMPS、GROMACS是什么？能干什么？怎么用？以及如何从简单的例子开始学起，做出能够发表的结果，具体相关事宜通知如下：两个课程分开授课，每个课程各三天。时间安排：第一天报到、授课三天。每天早上八点半至下午四点半，二十八号下午结束时间四点。 （麻烦可以转发给有需要的老师或同学！谢谢您们！） 时间地点：（时间安排：第一天报到、授课三天） GROMACS培训班 2019年5月30日——6月02日 北京 LAMMPS培训班 2019年6月06日——6月09日 北京 二、报名费用：? 此次培训为两个课程，每班每人￥3300元（含报名费、培训费、资料费），食宿费用自理。 5月20号之前报名汇款可享受优惠 400元，名额有限；如需开具会议费的单位请联系招生老师要会议邀请函； 三、培训特色： 1、小班授课，培训教室配备有服务器、投影； 2、对知识进行系统讲解，由浅入深，配合案例解析边讲边练，让学员能运用模拟软件针对每个技术点进行上机操作；授课老师和助教现场解决学员提出的各种专业问题，针对性的分析学员需求并提供指导，从而更好地满足学员不同方面的科研需求； 3、课堂上建立专属班级交流平台，学员学完后可以继续在班级群与老师同学交流问题，巩固学习内容。参加一次培训，后期可以免费再参加一次。 北京软研国际信息技术研究院 互动派（北京）教育科技有限公司 二零一九年四月二十五日 二零一九年四月二十五日 四、联系方式： 报名电话微信同号） 联 系 人: 马老师 报名邮箱163.com 报名QQ: 1182487556 官方网址： 附件一： “LAMMPS分子动力学模拟技术与应用”培训班大纲 课 程 内 容 第一天 上午 LAMMPS基础 1 分子动力学模拟入门理论——掌握lammps的in文件中各命令的意义 1.1系综理论 1.2主要算法介绍 1.3积分步长的选取 1.4温度和压力控制 1.5周期性边界条件 1.6分子动力学模拟流程 下午 LAMMPSS入门学习 2 LAMMPS入门操作基础 Linux命令入门基础——熟练掌握LAMMPS所用的Linux命令 2.2 LAMMPS中一些安装包的介绍——为以后创建自己体系进行选择性安装 2.3 LAMMPS的linux版串行和并行及GPU版编译安装——学会编译方法，针对自己体系编译软件。认识makefile文件。 2.4 LAMMPS的in文件结构格式及常用命令讲解、data文件格式。 2.5 LAMMPS实例讲解。 实例操作：编译安装自己的LAMMPS可执行程序。 第二天 上午 LAMMPS进阶学习 3. LAMMPS各种参数计算 3.1 in文件基本语法 3.2 颗粒模拟 3.3 可视化快照 3.4 弹性常数模拟 3.5 计算热导率 3.6 计算粘度 3.7 计算均方位移 3.8 计算径向分布函数 3.9 计算扩散系数 3.10 计算能量数据 3.11 Lammps常见错误解决途径 实例操作：学员结合自己的科研方向，选择运行契合自己研究方向的例子 第二天 下午 Lammps的建模 4. LAMMPS建模——掌握基本操作流程 4.1 建立各种晶体模型，Packmol，Material Studio，VMD 4.2 各种材料的data文件的建立，文件的结构以及参数说明 4.3 建立简单的有机物分子模型并集成为复杂的仿真模型 如何构建环氧树脂模型（Material Studio），构建仿真模型（vmd）。 4.4 如何修改力场参数 实例操作：MS建立环氧树脂/二氧化硅模型，并转换成lammps的data文件 第三