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第六章 细菌的分类与命名 一、生物的分类 六界:动物界、植物界、真菌界、原生生物界、原核生物界、病毒界。 细菌分类层次与其他生物相同,即:界、门、纲、目、科(Family)、属(Genus)、种(Species)。 * 二、细菌分类的指征 1. 形态学特性 2. 培养特性 3. 生活方式 4. 生理生化特性 5. 抗原构造 6. 对噬菌体的敏感性 7.对抗生素及其他化学物质的敏感性 8.病原性 9.遗传学特征。 * 三、细菌分类的方法 1、数值分类法 2.分子生物学分类法 3.血清学方法: 共同抗原 4.化学分类法:比较细菌各种细胞成分 * 1. 数值分类法 其分类范畴的基本单位是种,根据比较细菌在形态、生理和生化等方面的特性,计算出相似值来确定种的分类归属。 * 2.分子生物学分类法 (种系发生) 1)DNA中G+C摩尔百分数(%)含量测定 (G+C)mol%含量:某一生物DNA中的G+C配对碱基按摩尔数计算占全部碱基的百分数。(反映该生物遗传性能的一种本质特征)。 测定方法:梯度密度离心法、解链温度法(Tm)等。 * 2)DNA或RNA同源性的测定 DNA-DNA杂交试验(hybridization) 原理:同源DNA单链或非同源DNA单链,只要它们彼此在核苷酸序列上有相应互补的部分,就可产生不同程度的结合。 应用:通过在体外测定菌株间DNA的杂合率,据此推算出DNA的相似程度,判断它们在亲缘关系上的亲疏,帮助分类鉴定。 * 3)rRNA的分析 rRNA在遗传信息传递中起重要作用,特别是16S rRNA能反映各种细菌间在系统发生方面的关系。从该rRNA的碱基序列可绘制系统发生树。 * 四、细菌的分类体系 细菌分类有三个主要体系 前苏联、法国、美国 《伯杰氏分类系统细菌学手册》,该手册共四卷(1984-1989)。并于1994年出版了《伯杰氏鉴定细菌学手册》第9版,将细菌门分为33个部分,其中与兽医学和医学有关的计13个部分。 * 五、细菌种的划分和种以下的分类单位 (一) 种(Species) 种是生物分类的基本单位。凡属同种的生物,均具有共同的基本性状特征。它是生物在一定演化阶段,具有相对稳定的一定性状特征的实体。 * (二) 种以下的分类单位 1.亚种(subspecies):种内可能存在一些在某些性状上相互差异的类别。 2.型(type)与亚型(subtype):仅仅是某一方面的性状, 如血清型。型内还可按进一步的性状差异区分为不同亚型。 *
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