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第十二章 主成分分析
主成分分分析也称作主分量分析,是霍特林 (Hotelling) 在 1933
年首先提出。主成分分析是利用降维的思想, 在损失较少信息的前提
下把多个指标转化为较少的综合指标。 转化生成的综合指标即称为主
成分,其中每个主成分都是原始变量的线性组合, 且各个主成分互不
相关。 Stata 对主成分分析的主要内容包括:主成分估计、主成分分
析的恰当性(包括负偏协方差矩阵和负偏相关系数矩阵、
KMO(Kaiser-Meyer-Olkin) 抽样充分性、复相关系数、共同度等指标
测度)、主成分的旋转、预测、各种检验、碎石图、得分图、载荷图
等。
yij ai b j ij , i 1,2, , n j 1,2, , p
主成分的模型表达式为:
C
V
p
i vi vi
V
i
1
vi
v j
0
diag( 1 , 2 ,
, p ), 1
2
p
其中, a 称为得分, b 称为载荷。主成分分析主要的分析方法是
对相关系数矩阵(或协方差矩阵)进行特征值分析。
Stata 中可以通过负偏相关系数矩阵、负相关系数平方和 KMO值
对主成分分析的恰当性进行分析。 负偏相关系数矩阵即变量之间两两
偏相关系数的负数。 非对角线元素则为负的偏相关系数。 如果变量之
间存在较强的共性,则偏相关系数比较低。因此,如果矩阵中偏相关
系数较高的个数比较多, 说明某一些变量与另外一些变量的相关性比
较低,主成分模型可能不适用。这时,主成分分析不能得到很好的数
据约化效果。
Kaiser-Meyer-Olkin 抽样充分性测度也是用于测量变量之间相
关关系的强弱的重要指标, 是通过比较两个变量的相关系数与偏相关
系数得到的。 KMO介于 0 于 1 之间。KMO越高,表明变量的共性越强。
如果偏相关系数相对于相关系数比较高, 则 KMO比较低,主成分分析
不能起到很好的数据约化效果。根据 Kaiser (1974),一般的判断标准如下: 0.00-0.49, 不能接受( unacceptable );0.50-0.59, 非常差(miserable );0.60-0.69 ,勉强接受( mediocre );0.70-0.79, 可以接受( middling );0.80-0.89 ,比较好( meritorious );0.90-1.00,非常好( marvelous )。
SMC即一个变量与其他所有变量的复相关系数的平方,也就是复
回归方程的可决系数。 SMC比较高表明变量的线性关系越强,共性越
强,主成分分析就越合适。
成分载荷、 KMO、SMC等指标都可以通过 extat 命令进行分析。
多元方差分析是方差分析在多元中的扩展, 即模型含有多个响应
变量。本章介绍多元(协)方差分析以及霍特林( Hotelling) 均值向
量 T 检验。
12.1 主成分估计
Stata 可以通过变量进行主成分分析,也可以直接通过相关系数
矩阵或协方差矩阵进行。
1)sysuse auto,clear
pca trunk weight length headroom
pca trunk weight length headroom, comp(2) covariance
2)webuse bg2,clear
pca bg2cost*, vce(normal)
12.2 Estat
estat 给出了几个非常有用的工具,包括 KMO、SMC等指标。
webuse bg2,clear
pca bg2cost*, vce(normal)
estat anti
estat kmo
estat loadings
estat residuals
estat smc
estat summarize
12.3 预测
Stata 可以通过 predict 预测变量得分、拟合值和残差等。
webuse bg2,clear
pca bg2cost*, vce(normal)
predict score fit residual q (备注: q代表残差的平方和)
12.4 碎石图
碎石图是判断保留多少个主成分的重要方法。 命令为 screeplot 。
s
e
ul
a
v
n
e
gi
E
webuse bg2,clear
pca bg2cost*, vce(normal)
screeplot
Scree plot of eigenvalues after pca
2
5
.
1
1
5
.
1 2 3 4 5 6
Number
12.5 得分图、载荷图
得分图即不同主成分得分的散点图。命令为 scoreplot 。
webuse bg2,clear
pca bg2cost*, vce(normal)
scoreplot
2
t
n
e
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