普通生物化学学习方法：蛋白质.ppt

普通生物化学 学习方法 生物化学有与数学，物理和化学不同，它还没有进入定量科学的阶段，还处在定性科学阶段，不可能象物理数学那样通过公式，定理推出一个准确的结论。所以生物化学的学习还是以概念为主，当然也有规律和规则，学习时，应该以记忆为主，在记忆的基础上可以在一定限度内进行推理。 记框架、记逻辑、记忆基础知识之后就可以在一定范围内实现知识的推导。 但是，规律总结下来后总会有各种各样的不可避免的意外。 因为生命是有多样性的。一般规则背后总有些个别例外（这些例外在考试中被当作考点几率很大） 蛋白质化学 蛋白质(protein)是由许多氨基酸(amino acids)通过肽键(peptide bond)相连形成的高分子含氮化合物，具有稳定的构象和一定的生物功能。 分类：简单蛋白质（记忆特征） 清蛋白；球蛋白；醇溶蛋白； 谷蛋白；精蛋白；组蛋白；硬蛋白 结合蛋白质（记忆如何结合） 核蛋白 糖蛋白与蛋白聚糖 脂蛋白 色蛋白 磷蛋白 蛋白质元素组成：16%N，可用测定N方法测大概蛋白含量 组成蛋白质的基本（经过一定的水解后得到）单位：氨基酸 人体蛋白质的氨基酸仅有20种，均为L型（无手性的Gly除外）。 氨基酸 基本结构： 重点：记忆氨基酸的缩写和相应的R基（特殊性） 分类 非极性疏水性氨基酸 极性中性氨基酸 酸性氨基酸 碱性氨基酸 色氨酸 tryptophan Try W 5.89 丝氨酸 serine Ser S 5.68 酪氨酸 tyrosine Try Y 5.66 半胱氨酸 cysteine Cys C 5.07 蛋氨酸 methionine Met M 5.74 天冬酰胺 asparagine Asn N 5.41 谷氨酰胺 glutamine Gln Q 5.65 苏氨酸 threonine Thr T 5.60 2. 极性中性氨基酸 天冬氨酸 aspartic acid Asp D 2.97 谷氨酸 glutamic acid Glu E 3.22 赖氨酸 lysine Lys K 9.74 精氨酸 arginine Arg R 10.76 组氨酸 histidine His H 7.59 3. 酸性氨基酸 4. 碱性氨基酸 脯氨酸 （亚氨基酸） ? 半胱氨酸 二硫键 胱氨酸 非蛋白中氨基酸： 包含D-型氨基酸，β，γ，δ—氨基酸等。有的作为其它大分子合成的结构单元，如细菌细胞壁成分中的D-谷氨酸和D-丙氨酸，抗生素中的短杆菌素中的D-苯丙氨酸，有的作为代谢中间产物，如鸟氨酸，瓜氨酸。 氨基酸的性质 两性解离 有氨基和羧基，等电点是氨基酸阳离子和阴离子的趋势及程度相等，成为兼性离子，呈电中性时的pH 计算等电点要求计算不带电荷时的氨基酸pH 此时pH值公式推导为 重点在于找到哪个pK为电中性两边的pK pI = ———— pK1+pK2 2 化学反应 茚三酮反应：蓝紫色化合物，其最大吸收峰在570nm处，可作为氨基酸定量分析方法 （注：脯氨酸反应的话时黄色物质，440nm） 甲醛滴定：甲醛溶液与氨基加成放出质子，滴定质子即可得知氨基酸的量 与2,4-二硝基氟苯(DNFB)的反应：产生DNP-氨基酸，黄色。（丹磺酰氯DNS-Cl现在代替DNFB，荧光） 与异硫氰酸苯酯（PITC）的反应：先生成PTC-氨基酸再转变为PTH-氨基酸，变为PTH（测序的方法之一） 与亚硝酸反应：测定N2含量推测氨基酸 荧光胺反应475nm测定 蛋白质结构 蛋白质的分子结构包括 一级结构(primary structure) 二级结构(secondary structure) 三级结构(te