微卫星检测方法.docxVIP

微卫星 DNA 简单重复序(SSR)也称微卫星DNA也可称为SSRP(SimpleSequenee Repeat Polymorphisms) ，STMS(Sequence-tagged microsatellites) 。其串联重复的核 心序列为1 一 6 bp，其中最常见是双核昔酸重复，即(CA) n和(TG) n每个微卫 星DNA勺核心序列结构相同，重复单位数目10一 60个，其高度多态性主要来源 于串联数目的不同。SSF标记的基本原理：根据微卫星序列两端互补序列设计引 物,通过PCR反应扩增微卫星片段，由于核心序列串联重复数目不同，因而能够 用PCR的方法扩增出不同长度的PCR产物，将扩增产物进行凝胶电泳，根据分离 片段的大小决定基因型并计算等位基因频率。 SSRM有以下一些优点：(l) 一般检测到的是一个单一的多等位基因位点； ⑵ 微卫星呈共显性遗传，故可鉴别杂合子和纯合子； (3)所需DNA量少。显然， 在采用SSF技术分析微卫星DNA多态性时必须知道重复序列两端的 DNA序列的信 息。如不能直接从DNA数据库查寻则首先必须对其进行测序。 1 微卫星DNA勺构成及特点 微卫星又称简单序列重复(Simple Se-quenee Repeats，SSR)b —般 以 1-6 个碱基为核心序列， 首尾相连组成的串联重复序列。 这种序列存在于几乎 所有真核生物的基因组中， 含量