Maxent简明教程(翻译).pdf

Maxent 简明教程 史提芬-菲利普斯，ATT 研究项目 李垚 （译） 本教程介绍了应用最大熵模型模拟物种地理分布的基本操作方法，由 Steven Phillips，Miro Dudik 和 Rob Schapire 共同编写，并得到了 ATT 实验室研究项目、普林斯顿大学和美国自然历 史博物馆生物多样性与保护中心的大力支持。如果想对最大熵模型的原理、数据类型及分析方法 有更详细地了解，请参考： Steven J. Phillips, Robert P. Anderson and Robert E. Schapire, Maximum entropy modeling of species geographic distributions. Ecological Modelling, Vol 190/3-4 pp 231-259, 2006. 植 下一篇论文论述了最大熵软件最近更新后的特征： 物 Steven J. Phillips and Miroslav Dudik, Modeling of species distributions with Maxent: new 仅 extensions and a comprehensive evaluation. Ecography, Vol 31, pp 161-175, 2008. 限 科 本教程所使用的数据包括南美洲的气象数据、海拔数据和潜在植被图层。样本物种是褐喉三 趾树懒 （Bradypus variegatus ）。在此，我们假设全部数据文件均在同一个目录下，否则你需要使 自 学 用文件名前面的路径。 最 开始 用 前 下载 ，不 沿 Maxent 软件包含一个名为maxent.jar 的jar 文件，装有Java 1.4 或者更高版本的计算机均可运 行。Maxent 软件和相关文献的下载地址为 /~schapire/maxent ；Java 程序则可 准 微 从/javase/downloads 获取。使用Microsoft Windows 操作系统的计算机还需要下载文件 信 maxent.bat，并把它和 maxent.jar 存放在同一个文件夹内。下载网站里有一个名为 readme.txt 的 商 文件，它告诉了我们如何在计算机上安装应用程序。公 启动在使用Microsoft Windows 操作系统 用 众 的计算机上，只需要双击maxent.bat 即可启动Maxent 软 号 件，或者在运行窗口打开“java -mx512m -jar maxent.jar ”( “512 ”可以被你为程序设置的存储空 间兆比特数替代，文件路径因个人设置而异) 。接下来将出现以下画面： 粉 丝 提 供 在执行运行（run ）命令之前，你需要提供一个含有已知点位置信息的文件（样本），一个包 含环境变量数据的文件夹，一个输出文件夹。在我们的案例中，