微生物学实验9:利用互联网和计算机辅助基因分析鉴定细菌.pptVIP

  • 28
  • 0
  • 约小于1千字
  • 约 22页
  • 2020-11-25 发布于安徽
  • 举报

微生物学实验9:利用互联网和计算机辅助基因分析鉴定细菌.ppt

实验9:利用互联网和计算机辅助基因分析鉴定细菌;操作步骤:;;粘贴进行比对菌株的16S rRNA序列;一般默认搜索100条相似性从高至低排列的同源序列;登陆号;点击“登陆号”进入后显示的16S RNA序列;将序列制作成以下格式(FASTA 格式) ;分别将每一个菌株的16S rRNA制作成一个TXT文章,保存在一个文件夹下,包含你要鉴定的菌株序列。 ;利用ClustalX1.8软件进行同源比对。 ;加载完序列后运行同源比对“Do complete Alignment”。 ;设置同源比对结果的保存路径;比对完成后关闭ClustalX软件,这时会在D盘根目录下形成两个文件*.aln和*.dnd 。;;删去前端长于鉴定菌16S rRNA序列的其他菌的基因序列;先点这;点击关闭;点击加载D盘根目录下的“*.mega”;选择左边的“Nucleotide sequences”后,点击“OK”;设置完成后,点击“OK”;点击进行复制,粘贴到word里进行编辑; SJ060621

文档评论(0)

1亿VIP精品文档

相关文档