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病原分子诊断技术常规化实践
鲁辛辛
首都医科大学附属北京同仁医院
2017-11-9 （广州，分子质控）
主要内容
• 经典分子生物学技术应用
– 病原微生物鉴定
– 耐药基因、致病基因、生态遗传基因等检测
– 病原分子流行病学调查
• 深度测序的应用
– 将取代现有技术？
一. 病原微生物鉴定
• 基于标本的直接核酸鉴定
– 针对某病原体的real-time PCR
– 物种保守基因 （片段）扩增+Sanger测序
多种病原体 液相芯片 下游分析技术
– mPCR+ +
– 核酸杂交
• 基于菌落的快速核糖核蛋白鉴定
– MALDI-TOF MS
如此复杂的遗传信息临床如何应用
引起HUS （溶血性尿毒综合征）E.Coli
• Escherichia coli O104:H4 str. 2011C-3493Submitter: Los Alamos National Laboratory
• Human Pathogen
• Morphology: Gram:Negative, Shape:Bacilli, Endospores:No, Motility: Yes
• Phenotype: Disease: HUS
Size Pseudo
Type Name RefSeq INSDC GC% Protein rRNA tRNA Gene
(Mb) gene
Chr - NC_0186 CP00328 5.27 50.7 4,963 22 94 5,081 2
58.1 9.1
Plsm pAA- NC_0186 CP00329 0.07 47.1 80 - - 82 -
EA11 66.1 1.1
Plsm pESBL- NC_0186 CP00329 0.09 49.7 94 - - 94 -
EA11 59.1 0.1
Plsm pG-EA11 NC_0186 CP00329 0 50.8 1 - - 1 -
60.1 2.1
情景-1
患者，女， 岁
• 61
主诉：反复鼻塞、脓涕、头痛 月，以慢性鼻窦炎、真菌性
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