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PBS 脚本实例说明 【摘要】本文主要通过一个算例来详细描述 PBS 脚本。以下为提交 wrf 作业的脚本实例，解释说明部分用##开头和结尾。此 PBS脚本表明本次提交的作业申请计算资源为 2 个计算节点，每个计算节点 12 个 cpu 核，内存为 24G，其中红色部分，用户可根据具体需要进行修改。 #PBS -N wrf ##（#PBS 表示 PBS 指令，以#PBS 开头；-N 为 PBS 指令参数，用于指定提交作业名称，wrf 表示作业名）。## #PBS -l nodes=2:ppn=12 ##(#PBS 表示 PBS 指令，-l 为 PBS 指令参数，表示申请资源列表；nodes=2:ppn=12 表示申请 2 个节点，每个节点 12 个 cpu 核，之间用分号隔开。注意与输入文件保持一致)## #PBS -j oe ##(#PBS 表示 PBS 指令，-j 为 PBS 指令参数，表示合并标准输出和标准错误输出至同一个文件；o 表示标准输出文件的路径，e 表示标准错误输出的路径，缺省的情况下，PBS 系统把标准输出和标准错误输出放在用户提交作业的目录下。)## #PBS -l walltime=1000:00:00 ##(#PBS 表示 PBS 指令，-l 为 PBS 指令参数，表示申请资源列表；walltime 为估计最大运算时间，1000:00:00 表示设为 1000 小时 0 分 0 秒。若没有设置这项，系统会自动按所在队列默认处理，超时系统会自动中断作业。)## nodecpu=`cat /proc/cpuinfo|grep processor|wc -l` ## (反引号内的意思为计算系统可用的 cpu 核数目，然后赋值给变量 nodecpu。反引号即键盘左上角与“~”在同一键上的符号，英文为 Backquote)## id=`echo $PBS_JOBID|awk -F. {print $1}` ##（定义作业 ID 号）## NP=`cat $PBS_NODEFILE|wc -l` ##（计算申请的 cpu 核数目，并后赋值给变量 NP）## echo The Jobbed is $id echo Worker dir is $PBS_O_WORKDIR echo Excuting Hosts is flowing: cat $PBS_NODEFILE echo begin time is `date` if [ $NP -lt $nodecpu ];then sharecpu=$NP elif [ $(($NP%$nodecpu)) == 0 ];then sharecpu=$nodecpu else echo Error: if cpu number is larger than $nodecpu, it should can be divided by $nodecpu exactly !! exit -1 fi ##（这段为 if...elif; then 选择语句，意思是当所需的 cpu 核个数小于系统可调用的 cpu 核数时，调用计算所需的 cpu 核个数。否则......）## cd $PBS_O_WORKDIR ## (进入工作目录) ## mpirun -np $NP -hostfile $PBS_NODEFILE (绝对路径)/ wrf.exe