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高通量基因型鉴定技术的开发和应用
目录
摘要i
Abstractiii
缩略语表vi
1前言 1
1.1测序技术的发展 1
1.1.1第一代测序技术 1
1.1.2第二代测序技术2
1.1.3第三代测序技术4
1.1.4混样测序技术4
1.2分子标记技术的发展5
1.2.1分子标记的作用和特点5
1.2.2分子标记的种类5
1.3 SNP 的应用6
1.3.1构建高密度遗传图谱6
1.3.2分子标记辅助育种7
1.3.3基因定位8
1.3.4遗传多样性分析8
1.4 SNP 分型方法9
1.4.1直接测序法9
1.4.2KASP 技术,,,,, 10
1.4.3基因芯片法 10
1.4.4单链构象多态性分析 11
1.4.5高分辨率溶解曲线分析(HRM) 12
1.5本研究的目的与意义 13
2实验材料与方法 14
2.1实验材料 14
2.1.1植物材料 14
2.1.2二代测序所用平台 14
2.1.3酶与试剂 14
I
华中农业大学2020 届硕士研究生学位论文
2.1.4仪器与设备 15
2.2实验方法15
2.2.1玉米植株DNA 的提取 15
2.2.2两种不同策略SNP片段的扩增 16
2.2.3磁珠纯化20
2.2.4建库和二代测序20
2.2.5数据分析流程21
3实验结果22
3.1SGT 是一个高效的简单的基因型鉴定技术22
3.1.1对单个SNP位点的基因型鉴定验证SGT方法的可行性22
3.1.2 SGT 2 SNP 23
对 个 位点的基因型鉴定
3.1.3 SGT 5 SNP 25
对 个 位点的基因型鉴定
3.1.4 SGT 20 SNP 27
对不同数据量下 个 位点基因型鉴定结果的比较
3.2IGGT 是一个高效的精巧的基因型鉴定技术30
3.2.1对单个SNP位点的基因型鉴定验证IGGT方法的可行性30
3.2.2IGGT 2 SNP 32
对 个 位点基因型鉴定结果
3.2.3IGGT 5 SNP 33
对 个 位点基因型鉴定结果
3.2.4 IGGT
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