论文内蒙古2016-2018年度流行性感冒流行病学及病原学研究论文.docVIP

PAGE I 内蒙古2016-2018年度流行性感冒流行病学及病原学研究 目 录 中文摘要 1 英文摘要 3 1 前言 6 1.1 流行性感冒的提出 6 1.2 研究背景和意义 6 2 试验材料与方法 7 2.1 流感样病例流行病学监测 7 2.2 流感病毒实验室检测 8 2.3 流感病毒基因测序 13 2.4 流感病毒耐药性检测 13 3 试验结果 13 3.1 流行病学监测结果 13 3.1.1 总体情况 13 3.1.2 时间分布 14 3.1.3 人群分布 14 3.1.4 地区分布 14 3.2 病原学监测 15 3.2.1 总体情况 15 3.2.2 优势株变化 15 3.2.3 性别分布 15 3.2.4 地区分布 15 3.3 抗原结果 19 3.4 流感病毒全基因同源性分析结果 19 3.4.1 新甲型H1N1基因同源性分析结果 19 3.4.2 季节性H3N2基因同源性分析结果 20 3.4.3 流感病毒基因序列及进化树分析结果 20 3.5 流感病毒耐药性分析结果 25 4 讨论 26 4.1 流行病学监测分析 26 4.2 病原学分析 27 4.3 遗传进化分析 28 4.4 抗原性分析 29 4.5 耐药性分析 30 5 结论 30 参考文献 32 综述 35 致谢 43 作者简介 44 PAGE III 1 插图和附表清单 1. 图1 2016年内蒙古自治区ILI时间分布复合图 14 2. 图2 2017年内蒙古自治区ILI时间分布复合图 14 3. 图3 2018年内蒙古自治区ILI时间分布复合图 15 4. 图1 新甲型H1N1流感病毒HA基因系统进化树图 22 5. 图2 新甲型H1N1流感病毒NA基因系统进化树图 25 6. 图3 季节性H3N2流感病毒HA基因系统进化树图 26 7. 图4 季节性H3N2流感病毒NA基因系统进化树图 26 8. 表1 内蒙古自治区2016-2018年各年度ILI%表 13 9. 表2 内蒙古自治区2016-2018年ILI年龄构成表 15 10. 表3 内蒙古自治区2016-2018年ILI年地区分布表 17 11. 表4 内蒙古自治区2016-2018年流感病毒阳性样本构成表 17 12. 表5 内蒙古自治区2016-2018年ILI样本不同性别阳性率比较表 18 13. 表6 内蒙古自治区2016-2018年ILI样本不同地区阳性率比较表 19 14. 表7 流感病毒抗原分析表 20 15. 表8 新甲型H1N1同源性分析表 20 16. 表9 季节性H3N2同源性分析表 21 PAGE 15 摘 要 目 的 通过对内蒙古自治区19家哨点医院采集的2016-2018年度流感样病例的流行病学特征、病原学情况以及流感病毒的耐药性进行分析，得出此次研究的内蒙古自治区流行性感冒的流行病学特征及病原学特点，为预防和控制内蒙古自治区流感的流行提供一定的科学防控依据。方 法 1.收集内蒙古自治区2016-2018年度流感样病例的（ILI）资料，描述内蒙古自治区流感样病例在不同季节、不同地区、不同人群的ILI分布特征；2.采用核酸检测方法对2018年度内蒙古自治区19家哨点医院采集的ILI病例咽拭子标本进行流感病毒鉴定分型，对检测结果阳性标本利用MDCK细胞进行病毒分离培养，采用红细胞凝血抑制实验进行流感病毒的分型鉴定；3.通过GenBank网站下载当前国内外流感病毒各亚型流行参考毒株和世界卫生组织推荐的疫苗株DNA序列；通过NCBI的blast程序进行流感病毒基因序列比对，分析流感病毒的亲缘性关系；使用DNAStar软件进行流感病毒基因序列的重新剪切和连接，采用Mega7.0软件对测序的流感病毒毒株和推介疫苗株、国内代表株进行系统树构建，分析内蒙古自治区2018年度流感病毒基因的遗传进化特征和对神经氨酸酶抑制剂药物的耐药性。 结 果 1.流行病学监测结果：（1）从2016年到2018年，内蒙古自治区的19家哨点医院总共报告了235804例流感样病例（ILI），同一时期的哨点医院的门诊和急诊总数为1090297例，流感样病例在总的门诊和急诊就诊中所占的百分比（ILI％）为2.33％。全区15个流感监测网络实验室中共检测了35981个ILI样本，其中4728个为阳性样本，阳性率为13.14％。（2）从流行性感冒的时间分布趋势来看，2016-2018年内蒙古自治区流行性感冒各年度ILI%随时间的分布情况不一样而不尽相同，2016年度ILI%在春季的第5-13周比较集中出现了第