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For pers onal use only in study and research; not for commercial use
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间变性淋巴瘤激酶(ALK)突变的形式有过量表达、与其他基因形成融合基因,发生点突变 等等。ALK基因融合突变是非小细胞肺癌( NSCLC)常见的一种驱动基因,中国非小细胞肺 腺癌中ALK融合突变阳性的比例为 5.3%,在非小细胞肺腺癌、年轻患者(小于 60岁)以 及不吸烟的人群中发生率较高, ALK阳性的非小细胞肺癌被认为是一种分子亚型, 相对应的
靶向药物与EGFR分子亚型完全不同。
ALK融合基因突变主要在肺腺癌里常见, 一般肺鳞癌患者 ALK融合基因突变概率很低,
有报道说1400个肺鳞癌患者里 ALK融合基因的发生率为 1.3%。考虑到ALK总体突变频率 仅有5%,所以对于鳞癌患者也是可以做一下 ALK检测的。由于非小细胞肺癌里的驱动基因
突变一般是互相排斥的, 或者说一山不容二虎, 癌细胞也没有必要搞两个驱动突变。 有研究
说亚裔的EGFR、KRAS野生型的腺癌患者,ALK阳性比例高达30%-42%,因此如果发现 EGFR和KRAS是野生型,是更有必要测下 ALK基因的。
、ALK融合突变的检测
ALKALKALKALKV7ALKALKALKALKA.LKW4甸-V5V2AIKEML4EM L4EML#EIML4EML4wi TFG
ALK
ALK
ALK
ALK
V7
ALK
ALK
ALK
ALK
A.LK
W4甸
-V5
V2
AIK
EML4
EM L4
EML#
EIML4
EML4
w
i TFG
KIF5B
图1 :非小细胞肺癌中 ALK的重排形式
据报道,目前已发现 21种EML4-ALK的融合形式,另外 ALK还可能与TFG、KIF5B、
KLC1、PTPN3、STRN等基因发生融合,因此 ALK融合突变的诊断是存在一定难度的。下表 是关于ALK融合突变的诊断方法,及其相应的特点。
检St方法
障理和优缺点
免疫组化 <IHC)
原理:通过抗原和抗体的结含反应,配含信号级联放大来检测. 罗氏公司的Ventana IHC试剂盒可以达到与FI5H枪测结果 94兇100%的一致率口判读标准是肿瘤细胞胞浆出现濮状榇黄色 强染芭颖粒,胞膜着色则为阴性口欧盟和中国都已经tt* Ventana IHC用于检测ALK重排也
缺点:由于肿瘤异质性f靶蛋白的表达强度不均一?由于存在蛋 白或RNA陽解的可tb FFPE切片存储大于3个月的不建议 Ventana IHC 检测口
荧光匱检杂交 (FISH)
愿淫:E裔空针的FISH方去.说计丸与羯两个按针,分别标记 ALK基因的两掃-一旦ALK?因发生肝春重聲或壬辕’红绿信号 便出现分离,而没有狡生断裂的则呈班为黄色黃光信号■判读标 逆为单个视野中计数50个肿瘤细胞,>5曲的细胞出现分离信 号则判读为阳性如VJ0%訓胞出现分离倍号则判读为阴性、如 果10嫁50%的细胞出现分离信号则茗次挑迭50个肿瘤细抱, 看计數100个细胞,看是否有>15%的细胞出现片商信号〔仅限 用于雅培的少誰搭针试斉:主人
缺点:无法判断ALK的起合星,必须由经驰丰富的病理科医师来 完成,15%^lfS界値存在一定魯迷 兰二肿常异质性r取祥佬差 等巨暑 存在假阴性的可能*即flfcALK突变阳性.患者.
反转录PC R
(RT-PCR
原理:通过预先设计好的引杓对样生的RNA进行逆转录来检测 駐合突变,简便可行,并可以确定ALK的融含型匚
缺点占需宴高质量的RNA样本,临床大都分是石蜡样本,RNA 降解严重,影响检出率,导致假阴性的结果,大于2年的标本不 建汶使RT-PCR检测,推荐新醛肿瘤组駅样本。iSS IPCR引柯 只能檢测己虹的融台基因型,无法套括苛有的走含型?
髙通量测序
目前己经证实使反二代测序找术检测基因扩皓、基因畫排是W行 的.无且高通量观芋有戏于變坯ALK新的魁含突变形弍「无且仅 聲螯少量样本即可检测窑和基因的突变惰;兄三 缺点:价格较高,判读标准及后绫验证尊亟待解决.
表1 : ALK基因检测的方法
需要注意,临床常用的三种方法是 FISH、Ventana IHC 及RT-PCR,三种方法 FISH的
灵敏度最低。因此,如果是胸腔积液、细针穿刺取到的细胞学样本做成的蜡块,不建议使用
FISH,避免假阴性。另外通过抽血检测循环肿瘤 DNA ( ctDNA),循环肿瘤细胞(CTC)也
正在发展起来。总之在面对ALK检测结果模棱两可的时候, 一定要换一个检测方法去验证, 也没有哪一种方法灵敏度和特异性都是 100%
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