棉花驯化中花色苷合成基因的进化.pdfVIP

摘要 摘要 广泛存在于植物体内的次生代谢产物——花色苷，属于类黄酮类的天然化合物。这种 化合物既可作为 “自然染色剂”使植物花、果实等器官着色，也可因其具有抗氧化性而在 植物防御各类病虫害和避免紫外线损伤等方面承担重要功能。此外，由于花色苷在抗癌、 抑菌、预防心血管疾病等方面均具有重要作用，该化合物在医药、食品和保健等方面的价 值也日渐被世人所关注。尽管国内外学者已对诸多二倍体模式植物中的花色苷合成代谢途 径进行了深入地研究，但有关驯化的异源多倍体中该代谢途径的遗传改变还未有涉及。本 AADD Gossypium hirsutumL. 实验以基因组为 的异源四倍体陆地棉 （ ）作为实验材料，在 G.hirsutumL.var.yucatanenseHutch. 对比分析其栽培品种和野生变种 （ ）形态差异的基础 上，对其花色苷合成代谢途径中的7个结构基因（查尔酮合成酶基因CHS、查尔酮异构酶 CHI -3- F3H -3- F3H -4- 基因 、黄烷酮 羟化酶基因 、类黄酮 羟化酶基因 、二氢黄酮醇 还原酶 基因DFR、花青素合成酶基因ANS 和类黄酮-3-O-转葡糖基酶基因UFGT）的同源拷贝的 序列差异与表达分化进行了全面比较，主要研究内容及结果如下： 1、通过形态观察，发现栽培棉花的植株矮壮、枝叶的颜色呈深绿色、有毛，花期早、 花蕾大而多、花瓣纯色、基部无花斑，棉铃大、纤维长而颜色洁白；而野生变种的植株高 大细长、枝叶颜色鲜绿、无毛，营养生长突出，花期晚、花蕾小而少、花瓣基部有花斑， 棉铃小，纤维短且颜色偏棕黄。 2 7 CHS 、基于陆地棉转录组数据，对栽培棉花在花色苷代谢途径中的 个结构基因 （ 、 CHI、F3H、F3H、DFR、ANS、UFGT）的编码序列进行了识别。利用BLAST 方法，将 这些编码序列定位到已经释放的陆地棉全基因组上，并以此对这些基因的结构和染色体分 AA DD GossypiumarboreumL. 布进行了确定。同时，通过对分别具有 和 基因组的亚洲棉（ ） 及雷蒙德氏棉 （Gossypium raimondiiUlbr.）同源基因的系统发育分析，进一步确认和区分 7 A D homoeolog 了这 个基因在陆地棉内具有 基因组和 基因组的同源拷贝 （ ）。 3 7 、利用全基因组重测序技术，比较了野生和栽培棉花在 个结构基因编码序列上的 差异，结果发现二者之间仅在CHS、CHI、F3H 等基因的同源对间存在1-5个的SNP，而 F3H DFR UFGT SNP 在 、 、 基因的同源对间无 差异。这个结果体现了这些基因在野生和 栽培棉花中间享有高度的序列保守性。 4、利用荧光实时定量PCR 的方法，比较了7个结构基因在栽培和野生棉花叶片中的 6 F3H 表达情况，结果发现， 个基因的表达水平在栽培棉花中均明显下降，其中，