ClustalX做多序列比对分析图示.docVIP

一、实验目的：1、了解用ClustalX软件做多序列比对分析 2、掌握并实际操作用ClustalX做多序列比对分析 二、实验过程： 用ClustalX做多序列比对分析图示 1、打开程序 如下图所示： 2、Load Sequnce, 载入序列 如下图所示： 3、选择序列文件，FASTA格式的 如下图所示： 4、用文本编辑器察看FASTA序列文件内容，这里用的是记事本，推荐用EditPlus或者Ultraedit 如下图所示： 5、序列Load进去之后 如下图所示： 6、Do Complete Alignment, 通常情况下直接选这个即可，无须修改比对参数 如下图所示： 7、点Do Complete Alignment之后弹出的文件对话框，.dnd的是输出的指导树文件，.aln的是序列比对结果，它们都是纯文本文件 如下图所示： 点“ALIGN”之后开始等待，如果序列不多，很快就可以算完，如果数据很多，可能要等一段时间，这时候可以用眼睛盯着ClustalX的状态栏，那里会有程序运行状态和现在正在比对那两条序列的提示信息，看看可以消磨时间。。。 8、比对结束之后，我们可以看到这个结果 如下图所示： 二、在NCBI搜索CO1基因 1．NCBI首页： 2．搜索 3．下载序列： 三、用clustal X软件对下载的学列进行多学列对比： 1．用记事本查看序列： 2．序