基因组学作业---Copy.pptVIP

（2）蛋白质结构域预测 基于InterPro 数据库分析蛋白序列的功能、结 构和进化单元 http://www.ebi.ac.uk/interpro/ （1）保守区分析 保守区位置 （2）蛋白家族信息 结构链接 在其他物种中的分布 4 蛋白质三维结构预测 SWISS-MODEL预测结果 小结 1、Ail是一种亲水稳定性分泌蛋白。 2、成熟蛋白中存在跨膜螺旋。 3、二级结构和三级结构表明该蛋白主要由β-折叠反向平行组成，三维结构呈桶状。 小肠结肠炎耶尔森氏菌外膜蛋白Ail的生物信息学分析 制作人：苟小兰 专 业：遗传学 主要内容 一、 OMP研究目的、意义及进展 研究意义及进展： 1、随着抗生素在水产养殖中的滥用，细菌的耐药性日趋严重，相比之下对高效疫苗的研发也就越发重要。 2、目前，已有学者对耶尔森氏菌属外膜蛋白Ail进行了致病性、作用靶位点及在免疫中的防护作用等研究。 3、Ail作为耶尔森氏菌属一种特定的外膜蛋白，对其结构信息尚报道较少。 目的：本次以小肠结肠炎耶尔森氏菌外膜蛋白Ail基因序列为基础，对此进行一系列生物信息学分析，期望能对该蛋白的特性和功能有一定了解。为进一步对疫苗的研制提供理论依据。 二、Y. enterocolitica Ail核酸序列的简单分析 1 序列拼接 序列拼接常用软件： （1）Biolign （2）CAP （