微生物分子生态学研究方法.pptVIP

微生物分子生态学的一些研究方法; 微生物群落结构和多样性是微生物生态学研究的热点内容。;20世纪70年代以前：传统的培养分离方法，依靠形态学、培养特征、生理生化特性的比较进行分类鉴定和计数，认识是不全面和有选择性的，方法的分辨水平低。;虽然可以检测环境中的活细胞，并且对微生物生态学的发展起了很重要的作用。 采用配比简单的营养基质和固定的培养温度，还忽略了气候变化和生物相互作用的影响，这种人工环境与原生境的偏差使得可培养的种类大大减少 （不到1 % ）。 Amann 等人报道在自然环境样品中可培养的微生物占总的微生物数量的比例范围从0.001%（海水）到0.3%（土壤）。 不能全面地反映微生物区系组成状况，烦琐、耗时。;2、群落水平生理学指纹方法(CLPP);BIOLOG鉴定系统;3、生物标记物法（Biomakers ）;醌指纹法(Quinones Profiling);磷脂是构成生物细胞膜的主要成分，约占细胞干重的5%。在细胞死亡时，细胞膜很快被降解，磷脂脂肪酸被迅速的代谢掉，因此它只在活细胞中存在，十分适合于微生物群落的动态监测。;4. ERIC (肠杆菌基因间保守重复序列) -PCR指纹图谱技术;微生物分子生态学研究方法;微生物分子生态学研究方法;Di Giovanni 等用ERIC-PCR分析6种纯菌组成的混合菌的组成，获得了高重复性的指纹图谱，比常规R