质谱数据分析2014.pptxVIP

;复习;;;蛋白质组学研究的目标;;;Ionization methods;;MALDI m/z spectrum of a peptide mixture;The Quadrupole;;Collects and store ions in order to perform MS-MS analyses on them.;14;;蛋白质组学研究的目标;Top-down proteomics;;多肽质量纹鉴定;多肽质量纹鉴定;蛋白序列数据库;Protein sequence database;Uniprot（包含Swissprot和Tremble）;Integr8;FASTA格式的数据库;虚拟酶解;质量排列;肽和肽键;质量排列;质量纹;质量纹;PMF中的问题;质量相近的多肽;解决方案;多匹配;长蛋白和短蛋白;多个蛋白的情况;多肽质量纹：小结;蛋白质组学研究的目标;利用二级质谱图;;;;利用二级质谱图;典型二级质谱图;转换成MGF文件;母离子的碎裂过程;;;50;小练习;答案;一些常见的其它离子;;;Neutral Loss和Immonium Ions表;;多肽的修饰;Unimod;小练习2;答案;其它可能的离子;理论质谱图与实验质谱图;通过de novo方法手工鉴定以下二级质谱图代表的多肽序列;九步鉴定法;九步鉴定法;67;b2离子的m/z表;手工鉴定二级质谱图;鉴定;鉴定;鉴定;