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实验四 定量 PCR 扩增
姓名:李宗翰 专业:环境工程 学号: 1432999 同组人姓名:刘雪飞
一、实验目的
复习定量 PCR 原理,熟悉绝对定量的操作流程
二、实验原理
实时荧光定量PCR是在PCR反应体系中加入荧光基团,利用荧光信号累积 实时监测整 PCR 进程,最后通过标准曲线对未知模板进行定量分析的方法。在 PCR扩增的指数时期,模板的Ct值和该模板的起始拷贝数存在线性关系,通过 Ct值和标准曲线的分析对起始模板进行定量分析
三、 实验仪器及材料
real time PCR仪(ABI7500, RotorGene 3000),微量移液器,Tip 头,0.2ml 光学薄 壁管,8联PCR管,1.5ml离心管,SYBR Mix,引物及108 copy/ul标准品
四、 实验步骤
1、标准样品稀释:取4个1.5ml的离心管,写上标记107, 106, 105, 104,向每 管加入90卩l ddH2O,取10卩l 108 copy/ul的标样加入到107管中,充分混匀 后,从管中取10卩l 107 copy/ul的液体到106管中。按上述操作依次稀释,得到 5个倍数的标准样品。注意,每次稀释都要换 Tip头。
2、 配制预混液:取119卩l ddH2O、7卩l引物4204f、7卩l引物4448r和7卩l Rox 到装有175卩l SYBR Mix液的1.5ml离心管中,混匀。
3、 分装预混液:取 7 个小离心管,分别标记 108、 107、 106、 105、 104、 UNK (未知样)、NTC (阴性对照)。向其中分别加入42卩l预混液和4.7卩l模板(1-5
号加标样、 6 号加未知样、 7 号加等量 ddH2O) ,混匀。
4、 戴上手套取两个8联管,并排放置管架上。分别取上述样品 20卩l至第1-7 管中(第 8管空出),每个样品两个重复, 共14个样品。将加好样的 8联管振荡。
5、 设置分析仪参数如下:95T 3min; 95C 15s+60C 40s为一个循环,循环次 数40,融解曲线温度范围60~95T。振荡好的样品进机进行 PCR扩增。
6、 扩增后利用软件分析 CT 值及未知样的定量结果。
五、实验结果与讨论
1、实验结果如何?试分析 答:实验结果及分析如下。
、实验具体数据见下表
其中,A-E
其中,A-E为标准样品,F为位置样品,
G为阴性对照。每个样品做两个平行。
Quan tity Ct
Well
Task
Ct
Ct Mean
Ct SD
Qua ntity
Mea n
Qua ntity SD
Threshold
A1
STANDARD
8.2488
8.2527
0.0055
100000000
0.0712
A2
STANDARD
8.2565
8.2527
0.0055
100000000
0.0712
B1
STANDARD
11.3893
11.6598
0.38250.0712
B2
STANDARD
11.9303
11.6598
0.38250.0712
C1
STANDARD
15.3292
14.9668
0.5126
1000000
0.0712
C2
STANDARD
14.6043
14.9668
0.5126
1000000
0.0712
D1
STANDARD
19.4912
19.3080
0.2590
100000
0.0712
D2
STANDARD
19.1249
19.3080
0.2590
100000
0.0712
E1
STANDARD
22.5385
22.4196
0.1681
10000
0.0712
E2
STANDARD
22.3007
22.4196
0.1681
10000
0.0712
F1
UNKNOWN
8.9370
8.9691
0.045458302584
1695285.625
0.0712
F2
UNKNOWN
9.0012
8.9691
0.045458302584
1695285.625
0.0712
G1
NTC
32.5329
0.0712
G2
NTC
32.9549
0.0712
通过软件分析,由标准曲线得到的未知样品的定量结果约为 5.83X 107
、扩增曲线
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从扩增曲线中可以看出,样品均经历了良好的扩增过程。
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