2012CB910100-G-代谢相关蛋白质修饰在肿瘤发生发展过程中的作用及机制.docx

依托部门: 教育部上海市科委 依托部门: 教育部上海市科委 项目名称: 代谢相关蛋白质修饰在肿瘤发生发展过 程中的作用及机制 首席科学家: 赵世民复旦大学 起止年限: **至 2016. 8 一、关键科学问题及研究内容 关键科学问题 本课题将以代谢相关的5白质翻译后修饰为切入点，系统挖掘参与代谢诲修饰调 控的乙酰化和磷酸化等修饰酶及其修饰底物，系统挖掘被代谢物调控的下游被甲 基化和務基化等修饰的￡白；在此基础上研究其对细胞代谢的作用，作用的分子 机理以及在肿瘤发生中的变化规律和生理病理意义；并通过结构生物学方法寻找 通过干预修饰进而干预代谢的小分子化合物。具体地，将就如下关键科学问题开 展研究: 发展相关技术和研究体系，系统地挖掘代谢相关翻译后修饰的修饰诲及其底 物；探索相关5白质修饰诲类和底物通过何种网络及分子机制进行调控。 在肿瘤发生、发展过程中，代谢相关翻译后修饰如何变化，以及这些变化对 于肿瘤发生发展有何病理意义。 研究能否通过活性小分子化合物干预代谢相关翻译后修饰，进而干预代谢来 实现肿瘤的预防与干预。 主要研究内容 我们将以项冃组成员前期在代谢相关的罢白质翻译后修饰研究为荃础，从广度与 深度上扩展对代谢失调引发肿瘤机理的研究。在广度方面主要系统地发现参与细 胞代谢调控的翻译后修饰的修饰晦，以及被代谢物调控的下游底物S白和信号通 路。在深度方面主要研究各种翻译后修饰调节代谢的分子机理，重点研究乙酰化 修饰参与代谢调控的机制；在代谢物调控下游翻译后修饰和信号通路的分子机理 方面，我们将《点研究对组5白甲基化和ONA去甲基化晦的调控机理；同时, 用结构生物学的策略寻找针对上述具有治疗潜力的耙分子的活性小分子化合物。 代谢相关的蛋白质的修饰谱及其在肿瘤发生发展过程中的变化规 律 以肝癌和神经胶质瘤等癌症为模型，建立全细胞的与代谢相关的5白质乙酰 化、磷酸化、理基化.甲S化修饰鉴定的技术方法与平台。探讨这些肿瘤发病过 程中代谢欝的乙酰化、磷酸化修饰的动态变化，以及被代谢中间物调控的下游坯 基化、甲基化等5白底物与动态交化。 2?肿瘤发生发展过程中代谢组的变化规律及其与代谢相关修饰变化 的对应关系与调控机制通过代谢组学、遗传学以及生物化学策各，比较肿 瘤细胞与正常细胞中的代谢物组成特点，重点探讨代谢相关修饰改交与代谢组改 交的内在联系；建立能反应肿瘤特征的代谢组谱，力争发现肿瘤特异性代谢标志 3?肿瘤发生发展过程中一些代谢产物作用的信号通路及对肿瘤发生 发展的意义 系统地研究与肿瘤发生密切相关的糟酵解通路与三魏酸循环通路相关代谢中产 物在肿瘤发生发展过程中的作用机理。重点研究 酮戊二酸（KG）及其结构 类似的等代谢中间物影响各种 KG依赖的系列双加氣碍功能的分子生化机理及 其对细胞信号通路的影响，包括 KG对PHD、系列组5白去甲基化诲以及DNA 去甲荃化酶活力的影响以及相关双加氧酶活力被抑制/激活后细胞的生理交化, 特别是细胞在表观遗传性状及血管新生等生理性状受双加氧晦活力改交的影响。 4?筛选针对蛋白质修饰酶的活性小分子化合物及其作用机制 针对组学和机理研究所发现的具有重要价值的￡白质修饰?类（包括乙酰化?、 去乙酰化酶、双加氯?、坯S化诲及甲S化诲等）,采用基于结构生物学原理的 小分子干预物质的计算、模拟，从天然产物筛选或者人工克接合成出能干预5白 质修饰诲类活性的小分子化合物，通过对发现的活性小分子化合物进行生化、生 理功能进行验证，然后根据结晶学手段解析S白修饰诲与小分子化合物形成复合 体的三维晶体结构，根据小分子化合物与5白修饰酶结合的关键结构元素特点, 对可能成药的小分子进行优化及药理效应研究。 二、预期目标 总体目标 从代谢相关5白质修饰的发生、调节和动态相互作用机制及其生理病理意义这一 核心科学问題出发，构建高通量5白组学方法、系统地挖掘与代谢密切相关的5 白质乙酰、磷酸化、務基化及甲基化修饰诲类及其靶S白的5白质组学、系统生 物学和生物信息学内涵；用遗传和生物化学方法鉴定一批新的罢白质乙酰化修饰 欝类，用代谢组学方法比较乙酰化修饰晦类在生理及病理条件下5白组水平的 交化及闵此引起的代谢诲乙酰化修饰交化和细胞代谢组交化；建立全细胞水平的 奚白质務基化修饰靶S白數据库并确定一些关键務基化S白质的动态调控机制， 并研究它们的倍号调控网络；以机理研究为根据，通过结构生物学方法系统研究 S白修饰酶HAT、S1RT和双加続碍的结构，以及修饰诲与代谢中间物和修饰珞 底物组成的复合体的分子结构，利用结构信息，结合生物化学，生物物理学及细 胞生物学的方法，通过改变相关養白质以及它的整个复合体在此的作用位点的结 构来验证其生物学功能，为治疗修饰诲相关疾病提供小分子药物设计和优化的结 构模根，为修饰诲相关的癌症等疾病的治疗提供新