科教生化—蛋白质.ppt

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细胞核抗原的βαβ结构;纤溶酶原的ββ结构 ;β折叠在蛋白质中的不同形式;βαβ在蛋白质中(Rossmann folding);2、结构域(domain,p72);例如;(3) 意义;肌钙蛋白C的结构域 Structural domains in the polypeptide troponin C. This calcium-binding protein associated with muscle has separate calcium-binding domains, indicated in blue and purple.;两个铁原子;木瓜蛋白酶;四、球状蛋白质的三级结构 p70(tertiary structure);β-折叠;细胞色素C; 抹香鲸肌红蛋白的立体结构表示法(三级) ;?由124个氨基酸残基组成 ?多肽链折叠形成3个?-螺旋、6个?-折叠片以及一些?-转角和无规则卷曲 ?二级结构再组合形成近似卵圆的结构 ?表面有一个凹陷,构成酶活性中心的3个氨基酸残基就集中于此;肌红蛋白;血红素(Heme)是铁卟啉化合物,由4个甲炔基相连成为一个环形,Fe2+居于环中。铁离子有6个配位键,其中4个与吡咯环的N配位结合,1个配位键和肌红蛋白的93位(F8)组氨酸残基结合,氧则与Fe2+ 形成第6个配位键,接近第64位(E7)组氨酸。;血红素(Heme)是铁卟啉化合物,由4个甲炔基相连成为一个环形,Fe2+居于环中。铁离子有6个配位键,其中4个与吡咯环的N配位结合,1个配位键和肌红蛋白的93位(F8)组氨酸残基结合,氧则与Fe2+ 形成第6个配位键,接近第64位(E7)组氨酸。;核糖核酸酶A三级结构示意图;抹香鲸肌红蛋白(Myoglobin)的三级结构;五、蛋白质的四级结构 p83 (quaternary structure); Some proteins contain two or more separate polypeptide chains, or subunits, which may be identical or different. The arrangement of these protein subunits in three-dimensional complexes constitutes quaternary structure.;去氧血红蛋白; 原体(protomer):对称的寡聚蛋白质分子可视为由两个或多个相同结构成分组成,这种相同结构成分称为原聚体或原体。 例如:血红蛋白 (?2?2)的原体是??。;蛋白质的旋转对称 Rotational symmetry in proteins;蛋白质的旋转对称 Rotational symmetry in proteins;蛋白质的旋转对称 Rotational symmetry in proteins;实例:;O2 transport;血红蛋白四级结构;烟草花叶病毒(TMV);烟草花叶病毒外壳蛋白(亚基);微原纤维(4个右手卷曲的螺旋对);六、蛋白质空间结构稳定的因素 p73;构型与构象; 定义:???一种由弱酸性的供体基团(D-H)和一个具独对电子的原子(A)之间形成的最显著的静电作用力。(p75)  在生物系统中,D和A两者都是高电负性的N和O以及S原子。 ;生物体系中常见氢键 氢受体通常是氧或氮; 氢受体是另一个电负性原子.; 对于二级结构(主链构象)的稳定起主要作用 在蛋白质的主链上,有大量羰基氧原子和已与氮原子共价结合的氢原子,它们之间可产生氢键。氢键虽弱,但由于数量很大,对于二级结构(主链构象)的稳定起极其重要的作用。 对于维系蛋白质三、四级结构也起着一定的作用 某些侧链与另一侧链之间也能形成氢键,这对于维系蛋白质的三级结构和四级结构也起着一定作用。 ;2、范德华力;疏水键在蛋白质结构中的作用:   对蛋白质三、四级结构的形成和稳定起主要作用。;举例:蛋白质分子中的疏水键示意图 ;4、盐键(离子键);形成:两个半胱氨酸的巯基脱氢氧化可产生二硫键.;说明 ?二硫键可在同一条肽链内或不同肽链之间形成 ?二硫键属共价键,对于维持蛋白质的三级结构和生物活性起很大作用 ?并不是所有蛋白质都含有成对的半胱氨酸残基,因此二硫键没有普遍意义;6、配位键;血红素(Heme)是铁卟啉化合物,由4个甲炔基相连成为一个环形,Fe2+居于环中。铁离子有6个配位键,其中4个与吡咯环的N配位结合,1个配位键和肌红蛋白的93位(F8)组氨酸残基结合,氧则与Fe2+ 形成第6个配位键,接近第64位(E7)组氨酸。

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