结构生物学TE统讲003.ppt

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信封式构象 扭转式构象 呋喃糖环的折叠形式 糖环的折叠影响核苷酸的空间构象 单体核苷酸中糖环折叠C3’-endo与C2’-endo各占一半的比例 B-DNA螺旋中糖环构象为C2’-endo A-DNA螺旋中糖环构象为C3’-endo RNA螺旋中糖环构象为C3’-endo 碱基 腺嘌呤 A 鸟嘌呤 G 胞嘧啶 C 胸腺嘧啶 T 尿嘧啶 U 碱基环的原子编号 碱基的顺式和反式构象 碱基的顺式和反式构象 磷酸基团 核苷酸的构象角 DNA的结构 DNA的一级结构 双螺旋——DNA的二级结构 超螺旋——DNA的三级结构 三链和四链DNA的结构 DNA的一级结构 DNA的一级结构是脱氧核糖核苷酸以3', 5'-磷酸二酯键连接形成的长链 脱氧核糖和磷酸构成DNA的磷酸二酯主链,由糖苷键连接的碱基是DNA的侧链 磷酸基总是离子化的 核酸是聚阴离子 核苷酸链具有极性,方向:5’?3’ 每个核苷酸中有6-7个自由旋转的单键 核苷酸的序列编码了DNA中的遗传信息 Chargaff规则:双链DNA中 A = T & G = C 核苷酸中的碱基可以被修饰:DNA中A和 C有时被甲基化 DNA序列的测定 Sanger法(双脱氧末端终止法) Maxam-Gilbert法(化学降解法) DNA的双螺旋结构——二级结构 双螺旋结构的三种类型 B-DNA A-DNA Z-DNA B型DNA的结构 B型DNA是天然DNA的最常见的构象,Watson-Crick双螺旋模型就是B型DNA的构象 B型DNA的结构特征 两条反平行的多核苷酸链围绕同一中心轴相互缠绕。 磷酸-脱氧核糖主链在外,碱基在内。碱基平面相互平行叠加,与中心轴垂直,碱基平面的间距为3.4?。 每圈螺旋含有10对碱基,螺距34?。相邻两对碱基的夹角为36°,螺旋的直径约为20?。 两条链相对的碱基存在A-T, C-G的互补关系,A-T之间有两个氢键,C-G之间有三个氢键。 糖苷键是反式构型,脱氧核糖的折叠是2'内型 在DNA双螺旋分子上交替存在大沟和小沟

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