基于受体结构的药物分子设计20181122.pptVIP

活性口袋分析 在得到大分子的结晶结构或者预测结构以后，需要做活性位点分析。 是通过探针来探测简单的分子或碎片如何能够与生物大分子的活性位点很好地结合。用于分析的探针可以是一些简单的分子或碎片，例如水或苯环作为探针，通过分析它们与活性位点的相互作用情况，可以找到这些分子或碎片在活性部位中的可能结合位置。 活性位点分析法通常不能直接产生完整的配体分子，但它得到的有关受体结合的信息对后面的全新药物设计和分子对接等都有很好的指导意义。 代表性的活性位点分析方法的软件有GRID、MCSS和HINT等相关程序。 第二节 分子对接与虚拟筛选 分子对接（molecular docking）是通过研究小分子配体与受体生物大分子相互作用，预测其结合模式和亲和力，进而实现基于结构的药物设计的一种重要方法。根据配体与受体作用的“锁钥原理”，分子对接可以有效地确定与靶受体活性部位空间和电性特征互补匹配的小分子化合物。 What Is Molecular Docking? Docking is a term used for computational schemes that attempt to find the “best” matching between two molecules: a receptor and a ligand. Halperin, I.; Ma, B.; Wolfson