DNA序列比对同源性分析图解BLAST.pdfVIP

1 、进入网页： /BLAST/ 2 、点击 Search for short, nearly exact matches 3 、 在 search 栏中输入引物系列： 注：文献报道 ABCG2 的引物为 5’-CTGAGATCCTGAGCCTTTGG- 3’; 5 ’-TGCCCATCACAACATCATCT- 3 ’ （1 ）输入方法可先输入上游引物，进行 blast 程序，同样方法在进行下游引物的 blast 程序。 这种方法叫繁琐，而且在结果分析特异性时要看能与上游引物的匹配的系列，还要看与下游引物匹配的系 列—— 之后看两者的交叉。 （2 ）简便的做法是同时输入上下游引物：有以下两种方法。输入上下游引物系列都从 5’——3’。 A 、输入上游引物 空格 输入下游引物 B 、输入上游引物 回车 输入下游引物 4 、 在 options for advanced blasting 中： select from 栏通过菜单选择 Homo sapiens Expect 后面的数字改为 10 5 、在 format