超好研究生分子生物学课件基因组的结构与功能06.pptxVIP

第二章 基因组的结构与功能;基因组(genome) 基因组是指一种生物所包含的全部遗传物质. (The complete DNA sequence of an organism);;Fluorsecent In Situ Hybridization (FISH);基因组大小的表示: 原子质量（ku） 碱基对数目（bp） 质量单位（?g、ng、pg） 摩尔单位（pmol） 光密度单位：;;酵母 0.05 碗豆 5.0 果蝇 0.15 太阳花 5.3 鸡 1.3 小麦 7.0 人 3.2 蚕豆 14.6 羊葱 16.8 郁金香 31.2;DNA分子大小的比较;病毒基因组结构特点 1、结构简单，基因组小。 2、基因组由DNA或RNA组成。 3、有基因重叠现象。 4、RNA病毒基因组可以由数条不相连的RNA链组成 5、重复序列少；非编码区少。 6、可以形成多顺反子mRNA。 7、基因组是单倍体（除逆转录病毒）;DNA分子大小的比较;mRNA (+)链;Φx174基因重叠;基因组结构特点 1、环状双链DNA，约3200bp；L(-)和S(+)的5′端碱基互补，因而形成双链；长链（L链）的5’端连有一蛋白质，是转录的起点，产物为3.5Kb RNA。短链长度不定。 2、有广泛的基因重叠。 ;3、四个开放阅读框（open reading frame, ORF) S区：由pre-S1，pre-S2和S基因组成，编码病毒外膜蛋白。 C区：由pre-C和C基因组成。两个ATG被pre-C基因隔开，分别翻译出核心抗原和e抗原。 P区：长度为832～845个氨基酸。P区的表达产物是一个大蛋白质，切割成逆转录酶等。 X区：编码X蛋白，154个氨基酸 ，属核蛋白 核蛋白功能：（1）反式作用因子 作用于HBV启动子和增强子以及细胞的某些基因。 （2）参与HBV基因组与肝细胞基因组的整合。 ;; 基因组为一条（+）RNA，可直接作为mRNA使用 包括某些噬菌体（如βQ），多数植物病毒，动物小RNA病毒（如polio, HAV), 披盖病毒。 例：脊髓灰质炎病毒(poliovirus) polio基因组: 7434个核苷酸；复制酶(replicase)。;3′poly(A); （－）RNA病毒 类型： 杆状病毒：狂犬病毒（rabis），水泡口炎病毒 （VSV)； 副粘病毒：腮腺炎病毒（mumps），麻疹病毒 （measles），副流感病毒； 正粘病毒：流感病毒A,B,C型。;(-) RNA ;Influenza virus A, B and C HA: hemagglutinin,15 subtypies, H1, H2, H3 found in human. NA: neuraminidase, 9 subtypies, N1, N2 found in human.;第二节 原核生物基因组的结构与功能;1、原核生物染色体DNA的基本结构与功能;E.Coli bacterium大肠杆菌;lig;2、原核生物染色体基因组结构与功能特征 ;;;;;;原核生物复制;质粒(plasmid)：指细菌和某些真核细胞染色体外、细胞内的共价闭合的环状DNA分子（cccDNA）。 （1）除酵母杀伤质粒为RNA外，质粒为环状超螺旋DNA。 （2）分子量一般为106×108，小型质粒的长度一般为1.5~15kb。 （3）质粒的复制依赖宿主细胞的复制机器。质粒可以转移。 （4）质粒不是宿主细胞生长、繁殖所必需的物质，但他所携带的遗传信息赋予宿主细胞特定的遗传性状，如F质粒的 性别；