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生物质谱技术
概述
20世纪80年代产生的新的软电离方式,使得质谱能用于分析高极性、难挥发和
热不稳定性生物大分子成分可能;
电喷雾电离(Electrospray Ionization ,ESI)和基质辅助激光解吸电离(Matrix-
Assisted Laser Desorption Ionization, MALDI) 等在基因组学与蛋白质组学
方面已得到了广泛的应用;
生物质谱仪
现用于单核苷酸多态性研究的生物质谱仪主要有如下两种:
电喷雾电离源--四极杆质量分析器 (ESI-Q-MS )
基质辅助激光解吸电离源--飞行时间质量分析器 (MALDI-TOF-
MS )
特点
生物质谱用于SNP检测的优点:
(1 )准确 检测的是核酸的分子量(准确地讲是荷质比)
(2 )快速 获得一个质谱图只需要几秒钟
(3 )高通量,耗费少 可同时检测多个位点
(4 )易于自动化
生物质谱的应用领域
(1 )蛋白质和多肽的分析
(2 )多糖结构测定
(3 )寡核苷酸和核酸的分析
(4 )药物代谢
(5 )微生物鉴定
(6 )其他 :医用材料如人工血等研究
MALDI TOF/TOF 4800
A B C D
MALDI-TOF MS 工作原理
A.离子化区:生物分子和基质形成共结晶,在脉冲激光照射后发生离子化
B.电场加速区:离子束在电场中被加速,经过无电场的漂移管以不同的速度到达检测器
C.质量分析器(质谱) D.信号处理
单核苷酸多态性分析
• 单核苷酸多态性分析是由两个步骤组成特异性产物 ,然后对
此产物进行分析;
• 生成等位特异性产物方法有4种:
引物延伸
杂交
酶切
链接反应
单核苷酸多态性分析
引物延伸反应使用最广泛;
引物延伸反应 :通过PCR将DNA进行扩增,然后立即与一条延伸引物在紧挨
多态性位点的上游退火,dNTPs ,ddNTPs和聚合酶也被加入反应体系中。延
伸反应在多态性位点或多态性位点的下一个碱基终止;
引物延伸反应的产物由于延伸的碱基不同 ,分子量不同 ,经过MALDI-MS分
析后即可区分SNP;
单核苷酸多态性分析
Mass ARRAY分子量阵列系统结合了引物延伸反应和MALDI-TOF质
谱技术,采用质谱法直接检测SNP;实现高通量多重SNP分析;
每块芯片上可以进行384个客户样本×15个SNP位点的分型检测,能确
保每天实现70000 个SNP基因分型的高通量筛选检测。
A.PCR扩增
B. 引物延伸反应 延伸引物设计在紧
挨多态性位点的上游
C. MALDI-TOF质谱检测延伸反应
的产物
引物延伸反应--MALDI-TOF实现SNP检测
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