2.5 标准生物元件及生物元件库-简版PPT.pdf

标准生物元件及 生物元件库 1 • “由于缺乏标准化的DNA序 列组合技术，使得每一次 DNA组合反应，既是解决研 究项目的工具，本身也成 为了一项实验。” Knight, T. (2003), Idempotent Vector Design for Standard Assembly of Biobricks. MIT Artificial Intelligence Laboratory, MIT Synthetic Biology Working Group. • 生物工程使用的方法和零件如果能够标准化，就能 建立相容组件的设计库，方便设计者进行组装。 2 合成生物系统的生物砖（BioBrick） 生物砖(BioBrick),也叫生物积块(Biobuilder)。  可以更加方便、灵活、高效的使用DNA元件。 3 合成生物系统的生物砖（BioBrick） 像建筑行业的砖和IT行业的零件一样，生物积 块也有大有小，Part，Device，system都可以成 为生物积块。 只要经过标准化处理，具有标准的酶切位点， 都可以称其为生物积块。 4 –生物砖（BioBrick）是标准的生物元件，是具有 标准前、后缀的基因元件； –前、后缀分别含有两个限制性酶切位点，用于元 件之间的连接； ATG……GFP… 5 图 标 说 明 终止子部件(terminators) DNA部件，包括克隆位点、SCAR序列、重组位点、接合转座子等 蛋白质编码部件(protein coding parts) 报告 显示部件 / (reporters) 信号接收和发送部件(receivers and senders) 引物部件(primers) 转换部件(inverters) 启动子部件(promoters) 核糖体结合位点 (RBS) 蛋白质相互作用的结构域 (protein domain) 6 生物砖可以组成基因 电路或基因回路 (genetic circuit) • 代谢功能的基因电路； • 调控功能的基因电路； • 基因电路特点是：具有定量特性，有确定的应 答阈值，及明确的反应边界。 7 标准生物元件库 1. 最常用的标准元件库 /Frequently_Used