遗传学：基因组学.pptx

遗传性状突变/显隐性群体/分离交换/多态性分子标记连锁重组值♀♂AAXaaF2aABulkAABulkaaBulk aaBulk AAQTL: quantitative trait locus数量性状位点（QTL）是影响数量性状的一个染色体片段；QTL定位是确定数量性状基因在染色体上位置的一种方法；QTL 和QTLs。QTL定位的关键QTL定位的基本原则QTL定位的基本原则是关联度量的遗传变异和表型变异；群体的选择、用于度量表型个体选择和基因型判型个体的选择是所有QTL定位设计要重点考虑的因素；对于所有的QTL定位设计，标记等位基因和QTL等位基因之间的连锁不平衡(LD, the linkage disequilibrium)是必须的。为什么要定位QTL它为了解个体数量性状基因之间的行为和交互作用等基础知识提供了一条路径，允许建立更加真实的表型变异、选择反应和进化过程模型；将标记信息综合到遗传评估中，辅助人工选择程序，主要方式有marker-assisted selection (MAS) 和marker-assisted introgression (MAI) ；能进行基因的位置克隆，允许对当前存在的数量变异进行分子机制的研究，并通过直接的分子干预，进一步增加增效等位基因频率。 全基因组关联分析——英文名字叫Genome-wide association study简称——GWAS 全基因组关联分析——是指在全基因组范围内找出存在的序列变异，即/view/213537.htm单核苷酸多态性（SNP），从中筛选出与疾病/性状相关的SNPs。 全基因组范围内的SNP对某一复杂疾病/性状的影响——关联身高间的差异关联研究关联指两个或多个事件之间具有统计学依赖性等位基因关联： 等位基因频率随疾病性状显著增高或降低连锁不平衡： 紧密连锁而产生的等位基因关联关联研究常见类型病例—对照研究： 收集一组患者以及一组匹配的对照，比较侯选位点等位基因频率是否存在显著性差异 病例对照研究不需要确认家庭单位，容易收集研究对象，但是其缺点是疾病和位点间的等位基因关联可能因为人群混合产生，而不是由于遗传标记和染色体上导致性状的突变位点接近,因此选择对照就很必要传递不平衡检测（TDT）： 应用家系内对照比较传递与未传递给受累子代的等位基因频率有无差异 TDT有效利用未传递的等位基因作为对照,对照和疾病基因由同一个体提供，分层就被降低或者消除了“GWAS第一次高潮”截止到2010年12月，已经陆续报导和公布了关于人类身高、体重、血压等主要形状，以及视网膜黄斑、乳腺癌、前列腺癌、白血病、冠心病、肥胖症、糖尿病、精神分裂症、风湿性关节炎等几十种疾病GWAS的结果。累计发表了近万篇论文(9900篇)。确定了一系列疾病发病的致病基因、相关基因、易感区域和单核苷酸多态性(SNP)的变异，取得了很大成绩。GWAS发现的与人类性状或复杂疾病关联SNP位点（p5×10-8）不同颜色圆点代表不同性状或疾病进行 GWAS时需满足病例必须携带导致疾病的遗传因素 选择覆盖全基因组的SNP或CNV研究样本量达到足够的检验效能 采用高效可靠的数据分析方法以及进行重复验证检验等条件显隐性连锁交换/重组多态性分子标记的种类基因组与基因组学Genomes and Genomics“基因组(genome)”一词是1920年Winkles从GENes和chromosOMEs组成的。人体细胞的核型（Spectral Karyotype) 基因组概念 基因组(genome)泛指一个有生命体、病毒或细胞器的全部遗传物质；在真核生物，基因组是指一套染色体（单倍体）DNA。即物种全部遗传信息的总和。 物种遗传信息的“总词典” 控制发育的“总程序” 生物进化历史的“总档案” 1986年美国约翰·霍普金斯（Johns Hopkins）大学著名人类遗传学家和内科教授麦克库塞克（McKusick）造出了“基因组学”（Genomics）这个名词，意指从基因组水平研究遗传的学科。 在人类基因组计划（HGP)的影响下，分子生物学的重要目标已经从传统的单个基因的研究转向对生物整个基因组结构与功能的研究。生命科学正从全新的视觉角度研究与探讨生长与发育、遗传与变异、结构与功能以及健康与疾病等生物学与医学基本问题的分子机理，并形成了一门新的学科分支-- 基因组学。基因组学概念：基因组学是遗传学研究进入分子水平后发展起来的一个分支，主要研究生物体全基因组的分子特征。单位：基因组学强调的是以基因组为单位，而不是以单个的基因为单位作为研究对象。目标：认识基因组的结构、功能及进化，弄清基因组包含的遗传物质的全部信息及相互关系，为最终充分合理地利用各种有效资源，为预防和治疗人类遗传疾病提供科学依据。人类基因组研究的发现分析得知