基因识别【精品#x2d;ppt】.pptxVIP

第五节基因识别 主讲人：孙啸 制作人：刘志华;基因识别;NA;?非翻译区域(untranslated regions, UTR) 编码区域两端的DNA,有一部分被转录， 但是不被翻译，这一部分称为非翻译区域;?:?对于任何给定的核酸序列(单链DNA或 mRNA),根据密码子的起始位置，可 以按照三种方式进行解释。 ?:?例如，序列ATTCGATCGCAA (1) ATTCGATCGCAA (2) ATTCGATCGCAA (3) ATTCGATCGCAA ?这三种阅读顺序称为阅读框(reading;一个开放阅读框(ORRopen reading frame)是一个没有终止编码的密码子序 列。;基于基因密码子特性的识别方法;基本思想： 如果能够找到一个比较长的序列，其相应 的密码子序列不含终止密码子，则这段序 列可能就是编码区域。 .:?基本算法： 椅扫描给定的DNA序列，在三个不同的阅读 框中寻找较长的ORF。遇到终止密码子以 后,回头寻找起始南照子。c □ 这种算法过于简单，不适合于处理短的 ORF或者交叠的ORF。;?:?识别编码区域的另一种方法是分析各种 密码子出现的频率;?:?假设在一条DNA序列中已经找到所有的 ORF,那么可以利用密码子频率进一步 区分编码ORF和非编码ORF;?一个简单的统计模型 假设相继的密码子是独立的，不存在前后依 赖关系。;?第二种和第三种阅