植物代谢组学.pptxVIP

目录植物代谢组学的研究背景与意义植物代谢组学的研究方法代谢组学在植物学中的应用 前景与展望一：研究背景与意义是研究一个生物系统中所有组分成分（基因、mRNA、蛋白质等）的构成，以及在特定条件下这些组分间的相互关系的学科。 “基因组学反映了什么是可以发生的，转录组学反映的是将要发生的，蛋白质组学指出了赖以发生的，只有代谢组学才真正反映了已经发生的。” -------许国旺 代谢组：是指细胞或者生物体内的所有代谢物的总和，也有人将它定义为细胞、组织、器官或者生物体内的所有小分子代谢组分（主要是相对分子量1000以内的内源性小分子）的集合。 代谢组学：是通过考察生物体系（细胞、组织或生物体）受到刺激或扰动后（如将某个特定的基因变异或者环境变化后），其代谢产物的变化或随时间的变化，来研究生物体系的一门科学-------许国旺2008靶向分析方法非靶向分析方法代谢组学的应用领域分子生理学生分子病理学药物研发代谢组学环境科学基因功能组学其他营养学指数增长，高影响因子学术刊物上发表的论文较多，仅nature系列刊物论文就达到20余篇，核心论文引用率高，其中引用50次以上的有50多篇，100次以上的有11篇与转录组学 和蛋白质组学相比，代谢组学的优点：1、基因与蛋白质表达的微小变化会在代谢物上得到放大，从而使检测更容易2、代谢组学的研究不需要建立全基因测序及大量序列标签（EST)的数据库3、代谢物的研究种类远小于蛋白质的数目4、研究中采用的技术通用二：代谢组学的研究方 法 代谢组学分析流程包括： 1.样品的制备（-80℃下保存） 2.成分分析与鉴定 3.数据分析与解释 由于植物中代谢物的种类繁多，而目前可用的成分检测和数据分析方法又多种多样，所以根据研究对象不同，采用的样品制备、分离鉴定手段及数据分析方法各不相同。获得相应的生物标志物群，发现未知代谢途径，从而揭示生物体在特定时间、环境下的整体功能状态，为解释生命体的内在规律提供信息和线索1、样品的制备 植物代谢物样品制备分为组织取样、匀浆、抽提、保存和样品预处理等步骤。目前还没有适合所有代谢物的提取方法，通常只能根据所要分析的代谢物特性及使用的分析手段选择合适的提取方法，而提取时间、温度、溶剂组成和质量及实验者的技巧等诸多因素也对样品制备产生很大影响。 在分析之前通常用固相微萃取，固相萃取和亲和色谱等方法进行预处理。挥发性成分（VOCs）是植物代谢组中的一类关键致香成分对于挥发性样品可以采用顶空固相微萃取、动态顶空采集法的新技术进行样品采集。泵吸附管净化的空气涂有特殊吸附材料(活性炭、Tenax系列、Propak系列、等)的石英纤维顶空固相微萃取操作过程2、成分分析与鉴定代谢组学的技术平台 红外线光谱技术（IR)稀薄气液色谱技术（TLC)高效液相色谱技术（HPLC)高效毛细管电泳技术（HPCE)毛细管电泳与紫外线吸光率检测联用技术（CE/UV)毛细管电泳与激光诱导荧光检测联用技术（CE/LIF)液相色谱与质谱先后使用技术（LC/MS/MS)液相色谱与质谱和核磁共振技术功用(LC/NMR/MS) 气相色谱和质谱联用(GC/MS) 液相色谱和质谱联用(LC/MS) 毛细管电泳与质谱联用（CE/MS) 核磁共振技术(NMR) 以及傅里叶变换红外、光谱与质谱联用(FTIR/MS)目前最常用的分离分析手段 色谱原理：色谱法利用不同物质在不同相态的选择性分配，以流动相对固定相中的混合物进行洗脱，混合物中不同的物质会以不同的速度沿固定相移动，最终达到分离的效果。如此，各组分得以在色谱柱中彼此分离，顺序进入检测器中被检测、记录下来。柱色谱图气液色谱(GLC)液固色谱气相色谱(GC)正相分配色谱气固色谱(GSC)液液色谱反相分配色谱离子交换色谱柱色谱空间排阻色谱亲和色谱薄层色谱TLC色谱液相色谱(LC)平板色谱纸色谱TLC毛细管区带电泳平面层电色谱毛细管凝胶电泳电色谱毛细管柱电色谱毛细管胶束电动色谱毛细管电泳毛细管等电聚焦超临界色谱(SFC)毛细管等速电泳气相色谱仪气路系统进样系统分离系统温控系统检测记录系统高效液相色谱仪高效液相色谱法原理薄层色谱纸色谱分离叶绿素 质谱原理：质谱分析是一种测量离子荷质比（电荷-质量比）的分析方法，其基本原理是使试样中各组分在离子源中发生电离，生成不同荷质比的带正电荷的离子，经加速电场的作用，形成离子束，进入质量分析器。在质量分析器中，再利用电场和磁场使发生相反的速度色散，将它们分别聚焦而得到质谱图，从而确定其质量。质谱仪的基本结构及工作流程电子倍增管及其阵列 离子计数器感应电荷检测器法拉第收集器计算机控制与数据处理进样系统离子源质量分析器检测器电子轰击电离（EI）化学电离（CI）解吸电离（DI）喷雾电离（SI） 扇形磁场飞行时间质量分析器四极杆质量分析器四极杆离子阱离子回