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setwd( ):设定 R 软件当前工作目录。
getwd( ):查看 R 软件当前工作目录。
list.files( ):查看当前目录下文件。
file.show( ):显示文件。
file.access( )查看文件是否可读可写。:
file.create( ):创建一个文件。例如: file.create“( D:/lesong.xls” ).
dir.create( ):创建一个目录。例如: dir.create(D:/lesong).
file.remove( )删除一个文件。:
File.choose( )选择一个文件。:
读数据函数 read.table( )主要参数解释:
read.table(file, header = FALSE, sep = , quote = ,
dec = ., row.names, col.names,
as.is = !stringsAsFactors,
na.strings = NA, colClasses = NA, nrows = -1,
skip = 0, check.names = TRUE, fill = !blank.lines.skip,
strip.white = FALSE, blank.lines.skip = TRUE,
comment.char = #,
allowEscapes = FALSE, flush = FALSE,
stringsAsFactors = default.stringsAsFactors(), fileEncoding = , encoding = unknown) heade遗辑参数。指定是否文件第一行为变量名。
na.strings:旨定缺失文字。
skip:指定读数据跳过的行数。
nrows指定数据读入最大的行数。
dec:指定小数点记号。
sep:指定数据分割字符。
row.namesW col.namesB予数据行名和歹!J名。
读入数据其他相关函数:
readLines()K行读入数据文件。类似perl读数据方式。
scan( )将数据读作一行向量形式。:
read.delim(educ_scores.txt饺入文本文件(制表符分隔)。
read.csv(educ_scores1.csv”读入 CSV盥号分割)。
readBin( )读入二进制数据。:
readChar( )读入字符型数据。:
attach( ):把数据框的变量链接到内存中 .
一般作图函数 plot ()主要参数解释:
plot(x, y = NULL, type = p, xlim = NULL, ylim = NULL,
log = , main = NULL, sub = NULL, xlab = NULL, ylab = NULL,
ann = par(ann), axes = TRUE, frame.plot = axes,
panel.first = NULL, panel.last = NULL, asp = NA, ...)
type设置图形类型。具体为:
type=
a _ a
p“
点图
type=
l“
线图
type=
b“
点和线
type=
a _ a
c“
去掉点只有线段
type=
o“
线穿过点
type=
a . a
h“
从各点到 x 轴的垂线段
type=
a _ a
s“
基于左侧值的阶段图
type=
S“
基于右侧值的阶段图
type=
n“
只有轴,没有具体图形
xlim和ylim:设置图形x轴与y轴的范围。比如xlim(0,30).
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log:数据取对数
main设置图形的上标题。比如说: main= Genomics analysis
sub:设置图形的小标题。比如说:sub= another title” .
ann:逻辑参数。设置是否将系统默认的图形标签显示出来。比如: ann=F.
lty:设置线的类型。比如:lty=4.
xlab和 ylab:设置 x 轴与 y 轴的 lab5 比如 xlab= sample one .
frame.plot逻辑参数。设置图形是否输出外框。比如:frame.plot=F.
axe遭辑参数。设置图形是否显示 x轴和y轴。比如:axes=F.
asp设置图形屏幕高宽比(y/x).
lwd:设置线条的粗细。比如:lwd=4.
bg:设置数据点的填充颜色。比如:bg= pink” .
col设置数据点的外圈颜色。比如:col= blue” .
cex设置数据点的大小。比如:cex=2.7。
pch设置数据点的形状。具体为:
pch=19: solid circle,
pch=20:
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