案例上4蛋白质高级结构.pptx

蛋白质;上节复习氨基酸;L-氨基酸的基本结构;L型氨基酸 与 D型氨基酸;22种一级氨基酸的名称与符号*;21种氨基酸的分类*;非极性氨基酸;芳香族基团氨基酸;极性不带电氨基酸;极性带正电氨基酸;极性带负电氨基酸;出现在蛋白质上的氨基酸修饰;游离型氨基酸衍生物;氨基酸的理化性质;氨基酸的两性离子;等电点 (isoelectric point, pI);氨基酸等电点的计算;蛋白质一级结构的测定;19;20;Sanger试剂(FDNB)标记N末端;Edman 降解法(I);Edman降解原理图;Edman 降解法(II)-优越性;肽键的专一性水解(化学法);泛用酶： 胰蛋白酶（trypsin）； Lys-X, Arg-X (X≠Pro) 胰糜乳蛋白酶（chymotrypsin）；Y-X（Y=Y,F,W; X≠Pro) 嗜热菌蛋白酶（thermolysin）； 木瓜蛋白酶（papain）； X-Y (X=R,K,Q,H,Y) 胃蛋白酶（pepsin）； X-Y（Y=Y,F,W; X≠Pro) 枯草杆菌碱性蛋白酶（subtilisin） 专一酶： Lys-X; X-Lys; Arg-X; Glu-X; X-Asp; Pro-X; Asn-X , 商品名：Endoproteinase Asn-C;蛋白质;一级结构;蛋白质结构的层次;作用力 破坏因子 氢键：α-螺旋，β-折叠 尿素，盐酸胍 疏水作用：形成球蛋白的核心 去垢剂，有机溶剂 Van der Waals力：稳定紧密堆积的集团和原子 离子键：稳定α-螺旋，三、四级结构 酸、碱 二硫键：稳定三、四级结构 还原剂 配位键：与金属离子的结合 螯合剂 EDTA;;蛋白质的二级结构;蛋白质二级结构;肽键的特征;肽键（peptide bond）的形成;肽键将氨基酸与氨基酸头尾相连; 肽 键;肽键平面;两个肽平面以一个Cα为中心发生旋转;二面角(Dihedral Angle);肽链中的肽平面;Ramachandran Plot;蛋白质二级结构的主要形式;? -helix;肽平面的相叠形成α螺旋;46;莱纳斯·卡尔·鲍林（Linus Carl Pauling，1901年2月28日－1994年8月19日），美国著名化学家，量子化学和结构生物学的先驱者之一。1954年因在化学键方面的工作取得诺贝尔化学奖，1962年因反对核弹在地面测试的行动获得诺贝尔和平奖，成为获得不同诺贝尔奖项的两人之一（另一人为居里夫人）；也是唯一的一位每次都是独立地获得诺贝尔奖的获奖人。其后他主要的行动为支持维他命C在医学的功用。 鲍林被认为是20世纪对化学科学影响最大的???之一，他所撰写的《化学键的本质》被认为是化学史上最重要的著作之一。他以量子力学入手分析化学问题，结论却以直观、浅白的概念重新阐述，即便未受量子力学训练的化学家亦可利用准确的直观图像研究化学问题，影响至为深远，比如他所提出的许多概念：电负度、共振论、价键理论、混成轨域、蛋白质二级结构等概念和理论，如今已成为化学领域最基础和最广泛使用的观念。;Linus Carl Pauling (1901-1994);α- 螺 旋 的 特 性;氨基酸残基侧链可影响α-螺旋的形成;左旋和右旋的判断;Pauling预测的三种螺旋结构;Alpha helices on Ramachandran diagram;β-sheet; β-折叠的特点：; β-折叠有平行和反平行的两种形式: ;反平行β折叠;平行β折叠;β折叠的侧链位置;?-转角（β-turn）和无规卷曲;五种不同的转角;β转角相当于半圈3.010 螺旋;63;细胞色素C的三级结构;65;20种氨基酸在二级结构中出现的频率;;蛋白质的超二级结构和三、四级结构;蛋白质的结构层次;;超二级结构的类型;Ferritin(铁蛋白);The α helical coiled coil ;βαβ在蛋白质中(Rossmann折叠);GFP：?+?;β折叠在蛋白质中的不同形式;理论上四条β折叠有12种组合，但是…;Up and down βBarrel;Greek key 的由来;β barrel with Greek key ;β propeller ;β – sheet formed structure;结构域(domain);It is useful to think of proteins as containing discrete domains whose conformation is generally in