蛋白质组学精品课件.ppt

蛋白质组学;;对蛋白质的数量、结构、性质、相互关系和生物学功能进行全面深入的研究已成为生命科学研究的迫切需要和重要任务。 ;The era of ‘omics’-based science Genomics （基因组学） Post-genomic science （后基因组时代） Functional genomics （功能基因组学） Transcriptomics（ 转录组学） Proteomics （蛋白质组学） Metabolomics （代谢组学） Structural genomics （结构基因组学） Aim - 3D structures of all protein folds ! ; 第一节 蛋白质组学的概念及发展进展 第二节 蛋白质组表达模式的研究方法 第三节 蛋白质组功能模式的研究方法 ; 第一节 蛋白质组学的概念及发展进展 ; 蛋白质组（proteome）：PROTEins + genOME，意思是Proteins expressed by a genome（基因组表达的所有蛋白质）。 1994年由Williams和Wilkins提出，是一个动态的概念，指的是不同细胞在不同时相表达不同的蛋白质。 ;对应于基因组的所有蛋白质构成的整体，不是局限于一个或几个蛋白质。 同一基因组在不同细胞、不同组织中的表达情况各不相同 。 在空间和时间上动态变化着的整体。;蛋白质组学(proteomics) ;主要研究内容 ; 表达蛋白组学 The study of global changes in protein expression;2021/8/23; 基因组 转录组 蛋白组;2021/8/23;功能蛋白质组学(functional proteomics)的提出 ;从局部入手研究蛋白质组的各个功能亚群体。 将多个亚群体组合起来，逐步描绘出接近于生命细胞的“全部蛋白质”的蛋白质组图谱。;发展进展;美国国立癌症研究院（NCI）投资1 000万美元建立肺、直肠、乳腺、卵巢肿瘤的蛋白质组数据库。 NCI和FDA共同投资数百万美元建立癌症不同阶段的蛋白质组数据库。 英国建立三个蛋白质组研究中心对已完成或即将完成全基因组测序的生物体进行蛋白质组研究。 ; Celera公司投资上亿美元独自启动了全面鉴定和分类汇总人类组织、细胞和体液中的蛋白质及其异构体，构建新一代的蛋白质表达数据库的工作。; 1997年召开了第一次国际“蛋白质组学”会议 1998年在美国旧金山召开了第二届国际蛋白质组学会议 1999年1月在英国伦敦举行了应用蛋白质组会议 ; 我国也于1998年启动???蛋白质组学研究，在中科院上海生物化学研究所举办了两次全国性的蛋白质组学研讨会 ; 2003成立了中国人类蛋白质组组织（CHHUPO），并分别于2003年9月、2004年8月以及2005年8月召开了中国蛋白质组学首届、第二届及第三届学术大会，2004年10月在中国北京召开了第三届国际蛋白质组学会议。 ; 科技部已将疾病蛋白质组研究列入我国“973”计划项目和“863”计划项目；国家自然科学基金委员会也将“蛋白质组研究”列为重点项目。 我国在鼻咽癌、白血病、肝癌和肺癌蛋白质组研究方面取得了较大的进展。;第二节 蛋白质组表达模式的研究方法;研究蛋白质组组成成分、差异和功能;（一）蛋白质组研究中的样品制备 ;样品预分级的主要方法; 样品预分级主要作用在于提高低丰度蛋白质的上样量和检测灵敏度。;组织水平上的蛋白质组样品制备;激光捕获显微切割(laser capture microdissection，LCM) ;（二）蛋白质组研究中的样品分离;;2021/8/23;特 点;2-DE技术的缺点 ;新型非凝胶技术 ; （三）常见蛋白质显色技术 ;常见显色方法比较;考染和银染的比较;;;有机染料和银染;负 染;胶体扩散染料;有机荧光团染料;金属螯合染料;（四）凝胶的图像处理分析和胶内酶切;;;;;正常肝细胞和肝癌细胞的蛋白质组双向电泳差异表达谱;蛋白质的胶内酶切;;（五）质谱分析;原理;;Sir Joseph John Thomson - 1906年诺贝尔物理奖主要贡献：气态下离子导电的理论和实验探索??Frederick Soddy - 1921年诺贝尔化学奖主要贡献：使我们对放射活性物质的认识大大提高，另外他对同位素的起源和性质也作了出色工作。??Francis William Aston - 1922年诺贝尔化学奖主要贡献：使用质谱方法大规模的研究非