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实验十一 植物组织总DNA的提取及DNA的浓度测定 ;二、实验原理 ; 再加入苯酚和氯仿等有机溶剂,能使蛋白质变性,并使抽提液分相,因核酸(DNA、RNA)水溶性很强,经离心后即可从抽提液中除去细胞碎片和大部分蛋白质。上清液中加入异丙醇或乙醇使DNA沉淀,沉淀DNA溶于双蒸水或TE溶液中,即得植物总DNA溶液。之后可加入RNA酶降解其中的RNA,再用氯仿除去RNA酶,得到较纯的DNA制剂。; DNA的吸收光谱峰在260 nm处,据计算,测定此波长下DNA溶液的OD值,当OD260=1时,双链DNA含量约为50 μg/ml,据此可用紫外分光光度计测定溶液中DNA含量。
由于蛋白质的吸收峰在280 nm处,在测定DNA含量时,还常计算OD260/OD280之值,如该值为1.8-2.0时,认为已达到较高的纯度,如低于此值,表明其内含杂质较多,可能影响酶切反应。;水稻品种的幼苗叶片;四、实验器具、药品试剂; CTAB法流程图;五、实验方法;(6)冷却2 min后,加入氯仿-异戊醇(24:1)至满管,剧烈振荡2~3 min,使两者混合均匀;
(7)放入离心机中10 000 rpm离心10 min,与此同时,将600 μl的异丙醇加入另一新的灭菌离心管中;
(8) 用移液器轻轻地吸取上清夜,转入含有异丙醇的离心管内,将离心管慢慢上下摇动30 sec,使异丙醇与水层充分混合至能见到DNA絮状物;;(9)10000 rpm离心1 min后,立即倒掉液体,注意勿将白色DNA沉淀倒出,将离心管倒立于铺开的纸巾上;
(10)60 sec后,直立离心管,加入720 μl的75%乙醇及80 μl 5 M的醋酸钠,轻轻转动,用手指弹管尖,使沉淀与管底的DNA块状物浮游于液体中;
(11)放置30 min,使DNA块状物的不纯物溶解;
(12) 10000 rpm离心1 min后,倒掉液体,再加入800 μl 75%的乙醇,将DNA再洗 30 min;;(13)10000 rpm离心30 sec后,立即倒掉液体,将离心管倒立于铺开的纸巾上;数分钟后,直立离心管,干燥DNA(自然风干或用风筒吹干);
(14)加入50 μl 0.5 × TE(含RNase)缓冲液,使DNA溶解,置于37℃恒温箱约15 h,使RNA消解;
(15)置于-20℃保存、备用。;称取样品,液氮研磨,加入预热的(65℃ ) CTAB及β-巯基乙醇 ; 取提取的DNA溶液2 μl(约100-200 ng)至一干净的离心管,加入198 μl蒸馏水稀释。先200 μl蒸馏水至比色杯,进行紫外光空白测定,然后倒掉蒸馏水,加入200 μl已稀释的DNA溶液,测定260 nm及280 nm的光吸收值(OD260及OD280),计算DNA浓度及OD260/OD280比值。计算公式如下:
dsDNA=50×(OD260) × 稀释倍数
以上浓度单位为?g /ml;(1)叶片磨得越细越好。
(2)移液器的使用。
(3)由于植物细胞中含有大量的DNA酶,因此,除在抽提液中加入EDTA抑制酶的活性外,第一步的操作应迅速,以免组织解冻,导致细胞裂解,释放出DNA酶,使DNA降解。
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